Bio Technical フォーラム

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DNAのClean up トピック削除
No.8747-TOPIC - 2020/04/03 (金) 13:59:38 - AAA
DNAのClean up kitを使った実験をしています。
普段使っているのはNucleoSpin Gel and PCR Clean-upです。

エチジウムブロマイドやMidoriGreenのようにDNAと結合能のある物質を使用したあとにClean upをしているのですが、
DNAをClean upした場合、そのようなDNAと結合能のある物質ははずれているものでしょうか。
単純にDNAがカラムに吸着されて、それ以外の液中の夾雑物が除かれるという仕組みを考えると、もともとDNAに結合していた物質は、そのまま一緒に残ってしまうような気がするのですが?

どなたか詳しい方がおられましたら、ご教示お願いいたします。
 
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(無題) 削除/引用
No.8747-2 - 2020/04/03 (金) 17:49:16 - AP
>もともとDNAに結合していた物質は、そのまま一緒に残ってしまうような気がするのですが?

どういう結合様式なのか理解しているかしらん?
決して共有結合みたいなことはないので、希釈、洗浄すればEtBrなどは抜けます。ゲルを染めたあときれいな水に入れておくとEtBrは拡散等で抜けます(destainが必要なときはそうする)。

DNAのClean up 削除/引用
No.8747-1 - 2020/04/03 (金) 13:59:38 - AAA
DNAのClean up kitを使った実験をしています。
普段使っているのはNucleoSpin Gel and PCR Clean-upです。

エチジウムブロマイドやMidoriGreenのようにDNAと結合能のある物質を使用したあとにClean upをしているのですが、
DNAをClean upした場合、そのようなDNAと結合能のある物質ははずれているものでしょうか。
単純にDNAがカラムに吸着されて、それ以外の液中の夾雑物が除かれるという仕組みを考えると、もともとDNAに結合していた物質は、そのまま一緒に残ってしまうような気がするのですが?

どなたか詳しい方がおられましたら、ご教示お願いいたします。

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