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ウエスタンのバンドの真ん中が薄くなる時ありませんか? トピック削除
No.8793-TOPIC - 2020/04/25 (土) 17:40:25 - モヅ
実験ができないこんなときにこんな質問で恐縮ですが

スマイリングするでもなく、
それぞれのバンドの真ん中だけ薄くなることありませんか?
すべてのバンドがそうなるので

経験的に同じ抗体でもちゃんと均一なバンドになることもあれば、中抜けになることがあり、ボイルした時間などの条件で少し違うような気もしているのですが、詳しい機序についてご存じの方いらっしゃいませんでしょうか。
 
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No.8793-8 - 2020/04/26 (日) 09:17:39 - モヅ
APさん
大変勉強になり、積年のなんとなくの謎が溶けました。
ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.8793-7 - 2020/04/25 (土) 21:03:26 - AP
白抜けじゃなくて、やっぱりメニスカス効果ですね。
左から二番目だけじゃなくて、すべてのレーンで起こっています。
そのレーンはシグナルが弱いためにたまたま中央部が白くなっただけで、他のレーンも強度が違うだけで同じパターンです。

(無題) 削除/引用
No.8793-6 - 2020/04/25 (土) 20:56:22 - モヅ
連投すみません。
この左から2番目のバンドです。

(無題) 削除/引用
No.8793-5 - 2020/04/25 (土) 20:55:18 - モヅ
ともさん APさん

ありがとうございます。20μgアプライしておりぎりぎり多すぎではないかなと
思っていたんですが、結構細いwellに乗せたので濃度が高くなりすぎたのかもしれません。
ちなみにいわゆる白抜けかどうかわからなかったので画像を添付させていただきたく存じます。
https://drive.google.com/file/d/1SIRQWDvXBM1b2sZhs-kWsmJQGD3kT17U/view?usp=sharing

どうでしょうか??

(無題) 削除/引用
No.8793-4 - 2020/04/25 (土) 18:20:21 - AP
真ん中だけ薄くなるってのは、いわゆる「白抜け」なんですか。

(無題) 削除/引用
No.8793-3 - 2020/04/25 (土) 18:17:34 - AP
サンプルをアプライした時、メニスカスを生じて両端が高くなり中央が浅くなりますね。
直後に通電するとサンプルがレーンの両端に厚く中央に薄くなります。そのせいじゃないですが。

サンプルの体積が大きくなるとメニスカスが深くなりますからその傾向は強くなりますので、体積を抑えるようにする。
あるいはアプライしてからメニスカスが拡散で解消されるまでちょっと時間を置いてから通電する。
グリセロールなど比重を高める成分が多いとメニスカスが大きくなるので、濃度が高くなりすぎないようにする。

(無題) 削除/引用
No.8793-2 - 2020/04/25 (土) 18:08:31 - とも
サンプルの乗せすぎかなと。ECL反応にて中央部が急速に基質をしょうひするためですね。

ウエスタンのバンドの真ん中が薄くなる時ありませんか? 削除/引用
No.8793-1 - 2020/04/25 (土) 17:40:25 - モヅ
実験ができないこんなときにこんな質問で恐縮ですが

スマイリングするでもなく、
それぞれのバンドの真ん中だけ薄くなることありませんか?
すべてのバンドがそうなるので

経験的に同じ抗体でもちゃんと均一なバンドになることもあれば、中抜けになることがあり、ボイルした時間などの条件で少し違うような気もしているのですが、詳しい機序についてご存じの方いらっしゃいませんでしょうか。

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