全3件 ( 1 〜 3 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

(無題) 削除/引用 No.8875-3 - 2020/05/29 (金) 20:54:56 - ふみ probeの配列情報を見れたのではなかったかと思います。 その配列をmRNA databaseを対象に検索にかけたら良さそうです。

(無題) 削除/引用 No.8875-2 - 2020/05/28 (木) 20:20:53 - ema 私は外さないで解析を検討します。Affymetrixは短いプローブなので全長を補完する目的で複数プローブを作っていますが、一部どうしても同じ遺伝子名で同じデータにならない事はあります。もとのDATデータ（CELではなく）で確認できるなら観察しても良いと思います。 また、発現量はどのくらいで差が無いと言っていますでしょうか？低い値でのデータ比較では相当ぶれます。 仮の候補として入れて、PCRのプローブの位置を合わせれるなら近いものにして（これを言うのは遺伝子名は同じで違う場所の市販PCRプローブで異なるデータがでて悩む人がいるから）検討するのはいかがでしょうか。

Affimetrix　マイクロアレイ 削除/引用 No.8875-1 - 2020/05/25 (月) 22:57:52 - ゴリラーマン Affimetrixの3ダッシュIVTを用いて解析を行いました。 質問は、probe set が3つ同じ遺伝子であるのですが、その内、一つが、BioGPSで情報がありません。このようなprobeは信憑性が薄いため消されたのでしょうか?また、興味がある遺伝子について、real time pcr により発現をきちんと確かめますが、同じ遺伝子の数種類あるプローブのうち差があるものと無いものが混在している場合、それは候補遺伝子から外したほうがいいでしょうか。もちろん、スプライシングバリアントの可能性はあるかと思っていますが。経験上のお話でもよろしいのでコメント頂けたら幸いです。以上です。よろしくお願い申し上げます。

全3件 ( 1 〜 3 )　 前 | 次 　1/ 1. /1

パスワードを入力してチェックした記事を

チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する 名前  メール  　アドレス非公開    タイトル  本文       設定  クッキーを保存（次回の入力の手間を省けます） 上に上げない（トピックの一覧で一番上に移動させません） 解決（問題が解決した際にチェックしてください） 暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。 送信

---

〔使い方〕 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。

---