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リアルタイムPCR 検量線  トピック削除
No.9206-TOPIC - 2020/10/07 (水) 20:13:58 - まなと
プラスミドを導入した遺伝子そのものが、経時的にどの程度残存しているかを、ゲノムに対するリアルタイムPCRを実施する計画です。

コントロールはGAPDHの予定です。ゲノムで実施する場合、GAPDHの検量線をどのように作成するのか良いのか、ご教授ください。

質問1.以下のどちらが良いでしょう?
1)GAPDHに対するPCRを実施して、そのPCRプロダクトをアガロースゲルから切り出して、それを定量、希釈して検量線を作成する。
2)プラスミドにGAPDHの一部を挿入して、それを利用して検量線を作成する。

質問2.PCRの条件をそろえるために、検量線のそれぞれの検体にバックグラウンドとなる核酸を加えて、最初のゲノムの濃度をそろえるべきだと思うのですが、何を加えればいいのでしょう?それとも必要ない?

以上、初心者で申し訳ありませんが、よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.9206-2 - 2020/10/07 (水) 21:56:14 - qq
あげ足を取っているのではないのですが、

>プラスミドを導入した遺伝子そのものが、
これが理解できないです。書き間違えであれば訂正してください。

>経時的にどの程度残存しているかを、
>ゲノムに対するリアルタイムPCRを実施する計画です。
ここも何をしたいのか判然としないです。

単に細胞にトランスフェクションして、どの程度DNAが取り込まれていて、経時的に消失していくかを知りたいということでしょうか??
そうだとすると、選択肢とつながるのかなぁ?

リアルタイムPCR 検量線  削除/引用
No.9206-1 - 2020/10/07 (水) 20:13:58 - まなと
プラスミドを導入した遺伝子そのものが、経時的にどの程度残存しているかを、ゲノムに対するリアルタイムPCRを実施する計画です。

コントロールはGAPDHの予定です。ゲノムで実施する場合、GAPDHの検量線をどのように作成するのか良いのか、ご教授ください。

質問1.以下のどちらが良いでしょう?
1)GAPDHに対するPCRを実施して、そのPCRプロダクトをアガロースゲルから切り出して、それを定量、希釈して検量線を作成する。
2)プラスミドにGAPDHの一部を挿入して、それを利用して検量線を作成する。

質問2.PCRの条件をそろえるために、検量線のそれぞれの検体にバックグラウンドとなる核酸を加えて、最初のゲノムの濃度をそろえるべきだと思うのですが、何を加えればいいのでしょう?それとも必要ない?

以上、初心者で申し訳ありませんが、よろしくお願いします。

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