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(無題) 削除/引用 No.927-3 - 2012/09/16 (日) 00:52:49 - protein おお様 返信いただきありがとうございます。 確かに完璧な方法というのはないですね。。 多数のハウスキーピングの分布を見てみるというアイデアは試させて頂きます。 qPCRのhouse keeping gene arrayなんかに乗っている遺伝子をまとめてみてみようと思います。 他のご助言がありましたらまたよろしくお願いいたします。

(無題) 削除/引用 No.927-2 - 2012/09/14 (金) 08:10:11 - おお むずかしいですね。総シグナルでスタンダダイズするのが普通ではありますが、お気づきのようにつきつめていくと結局はどんな場合においてもパーフェクトなやり方はないわけで、、、 いろいろデーターを見ながらベターなものを探るしかないかもしれません。例えばなるべくた種類のハウスキーピングジーンをチェックしてそれらが全体のどの位置に分布するかとか、、、

マイクロアレイのnormalization方法 削除/引用 No.927-1 - 2012/09/14 (金) 02:11:35 - protein いつもお世話になっています。 ある細胞に特異的に発現する遺伝子を同定するため、 異なる複数の細胞種とともにマイクロアレイ解析を行なっています。 この実験においてどのような正規化を行なって 遺伝子プロファイルの比較をすべきかということについて考えています。 標的の細胞はどうも細胞あたりのtotal RNA含量が対照の細胞に比べ１０％程度であり、 これらの細胞間の比較に、通常行われているような全シグナルの総和での正規化でいいのかと考えております。 マイクロアレイの正規化に関しては数年前に少し勉強したきりで、 現在どのような議論がなされているかについては全くフォローできておりません。 何かご意見または参考になる論文等教えていただけましたら幸いに思います。

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