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培養液からのRNA抽出 トピック削除
No.9381-TOPIC - 2020/12/18 (金) 08:44:44 - RNA
新たな発注ができない中で新しい実験を追加実験で求められました。
それは、細胞培養液からRNAを抽出するというものです。
24ウェルプレートで培養細胞を飼い、その後培養し、上清を回収、そして1000gでデブリスや死細胞を除いたのちに、上清からRNAを抽出するというものです。

調べるとトリゾールLSという培養液等、液体からRNAを抽出する試薬が売られてましたが、購入できませんので、手元にあるトリゾール を利用できないかと考えて、マニュアルを読んだのですが、書かれてありませんでした。100 ulの培養液に対して1 mlほどのトリゾール を加えてどうにかならないかなと思いますが、うまくいかないものでしょうか?非常に貴重な上清なので、どうにか成功させたいです。

言葉足らずな文章かもしれませんが,よろしくお願いします.
 
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No.9381-7 - 2020/12/19 (土) 09:53:46 - RNA
書き込んでいただいた先生方、ありがとうございます。
トリゾール 1mlに対して、100マイクロの培養上清を用いることでウイルスゲノムを検出できました。
ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.9381-6 - 2020/12/18 (金) 19:51:55 - あの
培養上澄ではないけど、低級着グレードのマイクロチューブやチップを使って、
エタノール沈殿に先立って、エタちんメイトを添加して、微小のRNAを採取してます。

(無題) 削除/引用
No.9381-5 - 2020/12/18 (金) 14:49:51 - G25
通常のTrizolでも、試料体積はTrizolの10%以下にせよというインストラクションなので、逆に言えば10%までは許容されるということでしょう。

ウイルスなら高速遠心機でPEG沈できるんじゃないかな。

(無題) 削除/引用
No.9381-4 - 2020/12/18 (金) 13:14:42 - ii
ウィルスなら超遠心で落として上清を9割方除き、残りにトライゾールでも良いかも

(無題) 削除/引用
No.9381-3 - 2020/12/18 (金) 09:43:03 - RNA
おお先生
書き込み感謝いたします。
上清中に放出されるウイルスを想定していますが、非常に低いものと考えております。
グリコーゲンはキャリアとして用いる予定ですが、トリゾール LSまでは用意できそうにありません。

(無題) 削除/引用
No.9381-2 - 2020/12/18 (金) 09:25:02 - おお
>100 ulの培養液に対して1 mlほどのトリゾール を加えてどうにかならないかなと思いますが

ある程度の量あるなら回収できると思います。

培養液からのRNA抽出 削除/引用
No.9381-1 - 2020/12/18 (金) 08:44:44 - RNA
新たな発注ができない中で新しい実験を追加実験で求められました。
それは、細胞培養液からRNAを抽出するというものです。
24ウェルプレートで培養細胞を飼い、その後培養し、上清を回収、そして1000gでデブリスや死細胞を除いたのちに、上清からRNAを抽出するというものです。

調べるとトリゾールLSという培養液等、液体からRNAを抽出する試薬が売られてましたが、購入できませんので、手元にあるトリゾール を利用できないかと考えて、マニュアルを読んだのですが、書かれてありませんでした。100 ulの培養液に対して1 mlほどのトリゾール を加えてどうにかならないかなと思いますが、うまくいかないものでしょうか?非常に貴重な上清なので、どうにか成功させたいです。

言葉足らずな文章かもしれませんが,よろしくお願いします.

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