Bio Technical フォーラム

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複数施行の平均 トピック削除
No.9464-TOPIC - 2021/01/31 (日) 17:57:19 - 大坊
定量PCRをtriplicateで行ったものを3回繰り返した時、それぞれの試行にエラーバーがつくと思いますが、この3×3回をまとめた平均、標準偏差ってどのように計算したら良いのでしょうか?
自分の研究室で定量PCRをやった事ある人がいないので、色々調べてはいますがよくわかりません。
9個の平均という考えではないですよね…?
 
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No.9464-4 - 2021/02/01 (月) 04:02:36 - おお
>9個の平均という考えではないですよね…?
ちなみに各サンプルの平均値を求めてそれを平均しても、9個の平均をとっても同じ値になるけどね。ただしSDやSEMは違ってくるけど。

(無題) 削除/引用
No.9464-3 - 2021/02/01 (月) 03:58:47 - TK-1
n=1でSDは出せません。

体重を測るときに、同じときに体重計に3回乗って、平均と分散を出すことは、真の値一つに対して測定誤差を測るだけです。

qPCRは機械により、well-to-well variationがあるので、duplicateやtriplicateでやるだけのことで、一回の測定で得られる値は一つです。それを同じサンプルで3回やることには大した意味はないです。逆に毎回同じサンプルを図って明らかにばらつくなら、経時比較やサンプル間の比較は無理でしょう。

(無題) 削除/引用
No.9464-2 - 2021/02/01 (月) 03:57:01 - おお
同じサンプルからTriplicateした数値の平均値をそれぞれ求めて、その値をつかって3回の実験の平均値やSEMを求めなさい。

同じサンプルからTriplicateするのは測定方法でその平均値をそのサンプルの値とするということで、そういう観点ではSEMやSDは意味がありません(意味があるとしたらその測定方法の評価ということあるいは、一回の実験で統計処理する場合)。

同じサンプルからTriplicateするのは測定方法と書きましたがノイズがでる可能性がたかい測定機器などでは機械内でそういう処理をしています。たとえばNano dropのプロトタイプと言えるような機械があったけど(日立がだしてたかな)、吸光度を十回ぐらい測定してその平均値を提示します。Nano dropもおそらく同じやり方だと思っています。実験者にはそういった複数回の測定の平均のSEMなどは提示されませんし、測定精度が保証されていればいいだけのことです。私のラボにある蛍光、発光プレートリーダーもそうなっています。

複数施行の平均 削除/引用
No.9464-1 - 2021/01/31 (日) 17:57:19 - 大坊
定量PCRをtriplicateで行ったものを3回繰り返した時、それぞれの試行にエラーバーがつくと思いますが、この3×3回をまとめた平均、標準偏差ってどのように計算したら良いのでしょうか?
自分の研究室で定量PCRをやった事ある人がいないので、色々調べてはいますがよくわかりません。
9個の平均という考えではないですよね…?

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