Bio Technical フォーラム

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cDNA合成 トピック削除
No.6213-TOPIC - 2017/08/16 (水) 17:05:21 - cDNA
約4kbのcDNAを合成するために、oligodT primerを用いるか、random hexamerを用いるかで迷っているのですが、みなさんはこれくらいの長さのcDNAの場合、どちらを使用されますか?
 
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No.6213-7 - 2017/08/17 (木) 00:49:29 - おお
randomなら目的の領域をカバーしてないcDNAがたくさんできるので長いやつとか全長には不利だと思う。

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No.6213-6 - 2017/08/16 (水) 22:50:04 - 第三勢力
私はクローニングならrandom hexamerとoligo-dTを混ぜたものを使ってます。特に問題が起きたことはないです。このやり方で発現ベクター作製用に10kbp超のfull length cDNAを取ってきた経験が複数回あります。

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No.6213-5 - 2017/08/16 (水) 21:10:45 - mon
ただのoligo dTより、(RACE用tag+)dT18Vなんかも良いよ。

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No.6213-4 - 2017/08/16 (水) 18:18:41 - AP
目的によろ。
クローニングならoligo dT
qPCRなら断然randomが良い。

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No.6213-3 - 2017/08/16 (水) 18:08:47 - mon
目的による。
目的遺伝子のcDNA限定なら特異primer(その後PCRである目的領域を増幅するなら、その3'下流に設計する)。
RNA(cDNA)を今後も他の遺伝子増幅に使うなら、Oligo-dT(リンカー配列付き)とN6両方作っておく。

(無題) 削除/引用
No.6213-2 - 2017/08/16 (水) 17:20:01 - おお
I would use oligo-dT or specific primers.

cDNA合成 削除/引用
No.6213-1 - 2017/08/16 (水) 17:05:21 - cDNA
約4kbのcDNAを合成するために、oligodT primerを用いるか、random hexamerを用いるかで迷っているのですが、みなさんはこれくらいの長さのcDNAの場合、どちらを使用されますか?

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