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腸内細菌 PCoA 軸のアウトプット トピック削除
No.6758-TOPIC - 2018/03/11 (日) 15:40:23 - nazeudon
こんにちは。

腸内細菌の解析をRのphyloseqというライブラリを用いて解析しています。
PCoAを行ってグラフを出力することは出来るのですが,各軸に影響を与えている要因(菌種)をアウトプットする方法がわかりません。例えば軸1の正の方向に最も影響を与えているのは〜菌のように知りたいです。
どなたかご存知の方いらっしゃいましたらお願い致します。
 
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腸内細菌 PCoA 軸のアウトプット 削除/引用
No.6758-1 - 2018/03/11 (日) 15:40:23 - nazeudon
こんにちは。

腸内細菌の解析をRのphyloseqというライブラリを用いて解析しています。
PCoAを行ってグラフを出力することは出来るのですが,各軸に影響を与えている要因(菌種)をアウトプットする方法がわかりません。例えば軸1の正の方向に最も影響を与えているのは〜菌のように知りたいです。
どなたかご存知の方いらっしゃいましたらお願い致します。

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