お世話になります。
以前からとある二つの蛋白（A,B）を違う蛍光（緑と赤）で観察して、mergeした画像ではたくさんの黄色が見えてきました。そして、第３の蛋白(C)を投入することで前述の二つ蛋白は離れ、共局在が激減してしまいました。投入せず、投入済みの画像を3枚ずつ並んで、学会に参加したら、統計がないと言い放題だと指摘され、これから私は統計します。色々調べましたが、やはりわからないところが多いので、皆様に助言をいただければ幸いです。
私はzeissの顕微鏡でとった複数の写真をimagejで分析したら（coloc2）、たくさんの結果があります。どれを統計して、有意差を獲るのかわからないです。
例えば100x100pの写真で ch１とch２の共局在を分析したら、%ch1 to ch2 , % ch2 to ch1 , coR, Pなどが出てきます。そして２組の複数の写真のある結果を統計し、変わっている、変わらないという統計結果が欲しいです。
因みにしきい値を変えることでデータが変動するようですが（特にcoff）、この辺は全部ソフトに任せるものですか？元々Aの平均シグナル９０％はBと一緒、Cを加えることで４０％まで減少更に有意差ありというような統計をするつもりでしたが、閾値の変動によって、この値も変動しますので、心配でずっとやっていません。
皆様に教えていただければ幸いです。ありがとうございます。
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