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TCA沈殿とウエスタンについて トピック削除
No.7127-TOPIC - 2018/08/07 (火) 22:35:52 - ひろし
学部四年で研究室に配属され、先生からプロトコルを渡されたのですが計算が苦手なのもありよくわからないところがあります。先生が夏休みに入ってしまい聞けないのでこちらで聞いてみようと思おいました。

まず、サンプル3mlをTCA沈殿し、5xSB30μlに溶解しそのうち10μlをウエスタンに使用することで1mlスケールになるそうなのですが なぜ30μlに溶解するのかわからないです。また、10μlをウエスタンに使用するといのもピンときません。
TCA沈殿の際に何mlのSBに溶かすかというのはどのように決めているのでしょうか。
ちなみに、サンプルが2mlだったら20μlに溶解するようです。

初歩的というかバカな質問ですが、考えても分かりません。
お願いいたします。
 
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(無題) 解決済み 削除/引用
No.7127-4 - 2018/08/07 (火) 23:35:22 - ひろし
みなさんありがとうございます
よく分かりました

(無題) 削除/引用
No.7127-3 - 2018/08/07 (火) 23:19:29 - おお
最終的にSDSPAGEのWell(サンプルをのせる(いれる)ところ)にどれだけの容量、たんぱく質量をのせるかということです。

容量はWell(サンプルをのせる(いれる)ところ)からあふれたらのせられないので、自分が作った(使う)ゲルのWellにどれだけのせれるかあらかじめ把握しておいて決めればいいです。Wellに30μl入れるとであふれ出すなら、上限25μlほどで、それより少なくてもいいということになります。

たとえばそのサンプル3mlから10μlとり2.5μlの5xSBをくわえて全量のせたとします(TCA沈殿しないということ)。その場合あまりにもタンパク量が少なくて検出が難しいならもっとのせなければいけないでしょう。

そういう理由でサンプルを1mlのせたいと思ったとき、Wellに1mlのせることができません。ならば1mlを10μlにしたいと思いますよね。

1mlをTCA沈殿して10μlの溶液にすれば1ml分のせることができます。
1mでも少ないと思うなら3mlをTCA沈殿して10μlの溶液にすれば3ml分のせることができます(理論てきには)。

また、1mlをTCA沈殿して10μlの溶液にして全量ながすのも、3mlをTCA沈殿し、5xSB30μlに溶解しそのうち10μlをウエスタンに使用するのも一緒です。ただしチューブに10μl入れたとき、チューブの横に張り付いたサンプルとかを溶かすためにチューブ全体にいきわたるようにすることが難しいと思います。くわえてチューブには微量のTCAが残っていて10μlの5xSBでは中和しきれないかもしれません。

このような事を把握してご自身の実験ではどれだけのサンプルを用意してTCA沈殿後、どれだけの5xSBを加え、どれだけの量ウエスタンに使うか決めればいいでしょう。

(無題) 削除/引用
No.7127-2 - 2018/08/07 (火) 23:15:30 - qq
>なぜ30μlに溶解するのかわからないです。
そんな時は30ul以外のSBで溶解して何か問題がありそうか、考えてみたり、やってみられるとよろしいです。

TCA沈殿とウエスタンについて 削除/引用
No.7127-1 - 2018/08/07 (火) 22:35:52 - ひろし
学部四年で研究室に配属され、先生からプロトコルを渡されたのですが計算が苦手なのもありよくわからないところがあります。先生が夏休みに入ってしまい聞けないのでこちらで聞いてみようと思おいました。

まず、サンプル3mlをTCA沈殿し、5xSB30μlに溶解しそのうち10μlをウエスタンに使用することで1mlスケールになるそうなのですが なぜ30μlに溶解するのかわからないです。また、10μlをウエスタンに使用するといのもピンときません。
TCA沈殿の際に何mlのSBに溶かすかというのはどのように決めているのでしょうか。
ちなみに、サンプルが2mlだったら20μlに溶解するようです。

初歩的というかバカな質問ですが、考えても分かりません。
お願いいたします。

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