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遺伝子名の検索 トピック削除
No.8377-TOPIC - 2019/11/06 (水) 22:36:53 - PPP
お世話になっております。

気になっている酵素があり、遺伝子発現解析を行いたいのですが、遺伝子名がわからずに解析することができません。
このような場合はどのように対応するのがベストなのでしょうか?
お知恵をいただければ幸いです。

知りたいのは、以下2つです。

Glutathione Peroxidase = GPX??
Hydroxy Fatty Acid Dehydrogenase = ???
 
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No.8377-8 - 2019/11/07 (木) 14:09:38 - ちき
Canonicalなヒトの遺伝子名としては、HAO1、HAO2みたいですね。

ちなみに遺伝子名側から酵素のEC numberをたどると、EC 1.1.3.15となるので、一種類のタンパク質が1.1.3.15と1.1.1.98の両方の活性をになっているということでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.8377-7 - 2019/11/07 (木) 13:12:01 - おお
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Glutathione+Peroxidase
右のほうに生物種のリストがあるからそれで絞り込めば探すの楽になるはず。

https://www.brenda-enzymes.org/enzyme.php?ecno=1.1.1.98
Homo sapiens
three different forms: HAOX1, HAOX2, HAOX3
ちなみにHydroxyacid oxidaseという名前が使われているようです。

(無題) 削除/引用
No.8377-6 - 2019/11/07 (木) 12:10:42 - トピ主
やはりそうですか・・・

しかし、それでも検索に引っかからないのです___

(無題) 削除/引用
No.8377-5 - 2019/11/07 (木) 06:31:35 - mon
普通にNCBIでGeneで検索すれば良いだけ。
OMIMも見ておくと良いかも。

(無題) 削除/引用
No.8377-2 - 2019/11/07 (木) 03:38:21 - おお
遺伝子発現解析って何をするの?データーによっては番号だったりするし。まあ蛋白や遺伝子のデーターベースで検索すればすぐ出てくると思うけどご存じないですか?NCBIのデーターベースとか行ってみた?蛋白ならUniprotとか。

遺伝子名の検索 削除/引用
No.8377-1 - 2019/11/06 (水) 22:36:53 - PPP
お世話になっております。

気になっている酵素があり、遺伝子発現解析を行いたいのですが、遺伝子名がわからずに解析することができません。
このような場合はどのように対応するのがベストなのでしょうか?
お知恵をいただければ幸いです。

知りたいのは、以下2つです。

Glutathione Peroxidase = GPX??
Hydroxy Fatty Acid Dehydrogenase = ???

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