Bio Technical フォーラム

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定量PCRカットのエリア トピック削除
No.8628-TOPIC - 2020/02/05 (水) 22:16:35 - みずき
こんばんは

メトホルミン摂取した後に、心臓をカットして定量PCRを行いました。
気になっているのが、A群とB群で若干切る場所が異なってしまった際は、結果に影響してしまうでしょうか?
例えば左心室(30%)左心房(70%)群 vs 左心室20%左心房(80%)群のような感じです。

あ、水樹奈々ちゃんが好きです。
 
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No.8628-9 - 2020/02/09 (日) 02:33:20 - F
心臓を用いた実験はしてませんが、例えばマウス小腸の組織ならば、cecumからの距離で組織採取の位置をある程度揃えますし、肺であれば、分葉していない左葉全体からサンプルを取る場合が多いです(あくまで私個人としてはそうしているという事で、一般論ではありません)。

ANPとBNPの話はとても興味深いのですが、そのような可能性があるならば、例えば、左心室から組織採取する形で統一しても良いように思います。僧帽弁をまたいで心房と心室の組織を一緒に採取する必要もないような気もします。左心室でも心尖部に近いとどうか、みたいなレベルになると、専門の方の御意見を伺った方が良さそうですね。これまでに出ている論文では、どんな感じなんでしょう? 

(無題) 削除/引用
No.8628-8 - 2020/02/08 (土) 23:55:08 - みずき
皆さんはカットする範囲は気にしているんですか?

(無題) 削除/引用
No.8628-7 - 2020/02/07 (金) 11:58:58 - まま
心臓以外でもこの影響はdiscussionしないといけないのですかね?

(無題) 削除/引用
No.8628-6 - 2020/02/07 (金) 10:02:19 - 外科医
面白い話ですね。

これは心臓全体で解析した場合、心肥大(例えば左心室)の場合は、左心室の影響が大きくなるということですか?

(無題) 削除/引用
No.8628-5 - 2020/02/06 (木) 10:18:37 - ん
たとえばANPは主として心房で,BNPは主として心室で産生される。他の分子についても知りたいですね。切り出した部位を記録しているならばそれも変動因子として分析できるのでは。

(無題) 削除/引用
No.8628-4 - 2020/02/06 (木) 09:35:23 - asan
>A群とB群で若干切る場所が異なってしまった際は、結果に影響してしまうでしょうか?

tissue sampleでやる以上そういう”雑多”なものなのでそう言うことは当然起こりうるでしょう。腫瘍の含まれる組織とかね。だから、理想的には見たいポピュレーショんが、できるだけクローナルな集団を取るのが好ましい。

どうしても避けられないならば、客観的に苦情がきそうにない方法を取るとかね。qPCRのinternal controlも複数試した方がいいと思う。

そもそもカットする必要性がないならwholeから採取すればいいのでは?

(無題) 削除/引用
No.8628-3 - 2020/02/06 (木) 08:59:24 - ああ
おおさんのデータも偏り激しそうだな

なぜ科学的に評価できるデーターのようには思えないと思った。
完全にお前さんの思い込みだ

(無題) 削除/引用
No.8628-2 - 2020/02/06 (木) 01:08:07 - おお
そういう事になりかねないから、手技的にできる範囲でControlはTestと条件を揃えるのが基本何じゃないですか?あなたの見ているものがどの程度局所的に偏っているか知りませんが偏ってなくとも科学的に評価できるデーターのようには思えません。

定量PCRカットのエリア 削除/引用
No.8628-1 - 2020/02/05 (水) 22:16:35 - みずき
こんばんは

メトホルミン摂取した後に、心臓をカットして定量PCRを行いました。
気になっているのが、A群とB群で若干切る場所が異なってしまった際は、結果に影響してしまうでしょうか?
例えば左心室(30%)左心房(70%)群 vs 左心室20%左心房(80%)群のような感じです。

あ、水樹奈々ちゃんが好きです。

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