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Illumina MiSeqに長いDNAを投入できる? トピック削除
No.8726-TOPIC - 2020/03/21 (土) 01:06:00 - NGS
現在3000bp程のDNAをIllumina MiSeqで解析したいと考えています。2x300で解析する予定で、両端が読めればOKです。

このような大きなDNAをMiSeqで解析したことがある方はいらっしゃいますか。
通常MiSeqで解析する際はDNAを1200bp以下の長さに調整するようですが、3000bpのような大きなDNAですと、クラスターが形成されず全く読めないのでしょうか?
ある事情から3000bpより小さくすることは出来ず、このDNAをダイレクトにMiSeqで解析しなければなりません。
ご意見お待ちしております。
 
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(無題) 削除/引用
No.8726-3 - 2020/03/22 (日) 12:50:57 - NGS
gさん有難うございます。

そうでしたか。やはりPacBioで読むしか無いのかな…

(無題) 削除/引用
No.8726-2 - 2020/03/22 (日) 08:21:58 - g

隣のクラスターにブリッジされて、 うまく読めないです。

Illumina MiSeqに長いDNAを投入できる? 削除/引用
No.8726-1 - 2020/03/21 (土) 01:06:00 - NGS
現在3000bp程のDNAをIllumina MiSeqで解析したいと考えています。2x300で解析する予定で、両端が読めればOKです。

このような大きなDNAをMiSeqで解析したことがある方はいらっしゃいますか。
通常MiSeqで解析する際はDNAを1200bp以下の長さに調整するようですが、3000bpのような大きなDNAですと、クラスターが形成されず全く読めないのでしょうか?
ある事情から3000bpより小さくすることは出来ず、このDNAをダイレクトにMiSeqで解析しなければなりません。
ご意見お待ちしております。

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