Bio Technical フォーラム

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RNA-Seqの解析後のファイルについて トピック削除
No.9042-TOPIC - 2020/07/28 (火) 14:58:28 - ピスケ
いつも質問させていただいております。

RNA-seqの解析後についてですが
解析した後の各遺伝子の発現量の値が記されたファイルが出力されますが
同じ遺伝子（同じEnsembl ID）がファイル内に複数存在するものがあります。
Cuffdiffで解析した場合もBallgownで解析した場合も、同じ遺伝子が出力ファイル内に複数存在しているものがあります。これはisoform等の違いによるものでしょうか。

ご存知の方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。
　
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私も同様な疑問を持っております 削除/引用
No.9042-2 - 2020/09/03 (木) 18:08:48 - 塩鯖定職
私も同様な疑問を持っております。

この様な場合、Aveを取るのが正しいのかどうかが疑問です。

RNA-Seqの解析後のファイルについて 削除/引用
No.9042-1 - 2020/07/28 (火) 14:58:28 - ピスケ
いつも質問させていただいております。

RNA-seqの解析後についてですが
解析した後の各遺伝子の発現量の値が記されたファイルが出力されますが
同じ遺伝子（同じEnsembl ID）がファイル内に複数存在するものがあります。
Cuffdiffで解析した場合もBallgownで解析した場合も、同じ遺伝子が出力ファイル内に複数存在しているものがあります。これはisoform等の違いによるものでしょうか。

ご存知の方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。
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