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Real-time PCRの閾値の設定 トピック削除
No.9226-TOPIC - 2020/10/16 (金) 21:38:34 - bih
Real-time PCRの閾値の設定する場合みなさんはどのように決めてますか?
一般的には指数関数的に増えているところの中間くらいを設定すると思いますが、蛍光値などから計算して設定することも可能でしょうか?
 
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(無題) 削除/引用
No.9226-2 - 2020/10/17 (土) 06:26:46 - おお
対数メモリで蛍光強度をプロットして直線的に増えているところで線を引くとか、バックグランド平均値からバックグランドのStandard deviationの10倍の値を加算したところとか、、、

最近のqPCRマシーンは計算マトリクスが入っていてマニュアルでやるほうが珍しいような気がするのですが、マニュアルでやっている方はいるのでしょうか。。。

http://surf.ed.ac.uk/wp-content/uploads/2014/02/Setting-baselines-and-thresholds-.pdf

Real-time PCRの閾値の設定 削除/引用
No.9226-1 - 2020/10/16 (金) 21:38:34 - bih
Real-time PCRの閾値の設定する場合みなさんはどのように決めてますか?
一般的には指数関数的に増えているところの中間くらいを設定すると思いますが、蛍光値などから計算して設定することも可能でしょうか?

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