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リアルタイムPCRのtwice in triplicateについて トピック削除
No.9278-TOPIC - 2020/11/05 (木) 02:43:56 - マウス
リアルタイムPCRについての質問です。

よく、twice in triplicateという記述がありますが、
triplicateはtechnical repとして、1回目と2回目のデータは、解析ではどのように扱えばよいのでしょうか。
単に「technical repが6こ」と考えるのでしょうか。

お詳しい方がおられましたら、よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.9278-7 - 2020/11/07 (土) 09:55:16 - qq
あれぇ、そうなのかなあ?
ある遺伝子発現が一回目のtriplicateで2.5倍増加していて、もう一回実験すると、2.0倍増加していたとすると、一体全体、その遺伝子発現は何倍増加したことになるのでしょう?
1回目は2.5倍、二回目は2.0倍というつもりなのかなあ?
三回目も実験して、2.3倍だったとして、その平均とSDを考えるのではないかなあ?
twice in triplicateよりも、thrice in duplicateじゃあない?

標準偏差か標準誤差かの違いでは? 削除/引用
No.9278-6 - 2020/11/06 (金) 19:34:29 - くわがた
エラーバーについて,標準偏差でただ個々のデータのバラツキを示せばOKならtripricateを1回でもいいでしょう.
平均値の再現性からデータの信頼性を示したいのであれば,同じn数の実験を2回以上行い,標準誤差で平均値のエラーバーを示すことになるんじゃないでしょうか.

(無題) 削除/引用
No.9278-5 - 2020/11/06 (金) 03:00:17 - おお
再現性を見ないといけないということ。
そのため3回実験してそれを示せという話もある。
まさか1回やってそれでよければデーターにできると思っているのだろうか。

(無題) 削除/引用
No.9278-4 - 2020/11/06 (金) 02:03:41 - マウス
みなさま、ご回答いただきありがとうございます。
やはり2回目は確認といった意味が強いのですね。

(無題) 削除/引用
No.9278-3 - 2020/11/05 (木) 10:54:42 - おお
>よく、twice in triplicateという記述がありますが、

文脈を確認しないと解釈しにくいですが、「トリプリケートで2回(行なった)」
テクニカルトリプリケートの実験を2回したというふうに感じます。

テクニカルトリプリケートの一方のデーターをRepresentativeとして示せばいいと思います。

>triplicateはtechnical repとして、1回目と2回目のデータは、

1回目のtriplicateは1回目の実験の数値を決めるためのもので2回目と一緒にするのはおかしいと言えることが大抵だと思います・

(無題) 削除/引用
No.9278-2 - 2020/11/05 (木) 05:01:41 - aaa
そんな精密に解析しないといけないほどの価値があるわけでもないし(クリティカルなデータにはなりません)、そもそも何度も何度も測定してあーだこーだするほどばらつくわけでもないし、好きにしたらええんちゃうの?

・2回目はただの確認
・1回目の3点の平均を出して、2回目も3点の平均をだしてそれらの平均
・その他

リアルタイムPCRのtwice in triplicateについて 削除/引用
No.9278-1 - 2020/11/05 (木) 02:43:56 - マウス
リアルタイムPCRについての質問です。

よく、twice in triplicateという記述がありますが、
triplicateはtechnical repとして、1回目と2回目のデータは、解析ではどのように扱えばよいのでしょうか。
単に「technical repが6こ」と考えるのでしょうか。

お詳しい方がおられましたら、よろしくお願いします。

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