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遺伝子の過剰発現とノックアウトで表現型が同じ事例 トピック削除
No.9420-TOPIC - 2021/01/09 (土) 01:00:47 - BlueComma
いつも勉強させていただいております。

表題のとおりです。過剰発現の表現型と遺伝子ノックアウトの表現型が同じになるケースってあるのでしょうか?ご存知の方がいらっしゃいましたらご教授いただけますと幸いです。
 
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(無題) 削除/引用
No.9420-12 - 2021/01/10 (日) 12:07:55 - s
Mad2のknock-outは致死ですが、reduced expressionとoverexpressionは共に染色体分離異常をもたらします。

https://doi.org/10.1016/j.ccr.2006.12.006

(無題) 削除/引用
No.9420-11 - 2021/01/10 (日) 09:45:09 - おお
しつこいようですが

Differential functions of mPer1, mPer2, and mPer3 in the SCN circadian clock
K Bae 1 , X Jin, E S Maywood, M H Hastings, S M Reppert, D R Weaver
PMID: 11395012

PERIODのKOでcircadian clockが乱れる例


Rhythmic PER abundance defines a critical nodal point for negative feedback within the circadian clock mechanism
Rongmin Chen 1 , Aaron Schirmer, Yongjin Lee, Hyeongmin Lee, Vivek Kumar, Seung-Hee Yoo, Joseph S Takahashi, Choogon Lee

PMID: 19917250 PMCID: PMC3625733

PERIODのOEでcircadian clockが乱れる例

(無題) 削除/引用
No.9420-10 - 2021/01/10 (日) 03:27:49 - おお
もう一つ見つかりにくいのはOEだけの報告KDとかKOの報告が別の論文だったりする場合もあるからだと思います。

(無題) 削除/引用
No.9420-9 - 2021/01/10 (日) 03:25:34 - おお
>[Re:7] BlueCommaさんは書きました :
> 情報ありがとうございました。
>
> 仰る通り緻密なバランスの上で成り立つ細胞のことなので、表題のような事例は山のようにあるのが真理だと思います。しかしながらそのような報告をあまり聞かないなと思ったので質問させていただきました。解釈が複雑になるので敬遠されがちになるということでしょうか、、、

Descriptive な論文もあるし、マウスKOの結果など解釈が難しいものでも真実をしるきっかけになるので何らかの発表があると思います。

(無題) 削除/引用
No.9420-8 - 2021/01/10 (日) 02:32:34 - おお
探せば沢山あるとのことですが、探してもあまり見つからないかもしれません。
高レベルで出版バイアスがかかっているはずです。

(無題) 解決済み 削除/引用
No.9420-7 - 2021/01/10 (日) 02:06:58 - BlueComma
情報ありがとうございました。

仰る通り緻密なバランスの上で成り立つ細胞のことなので、表題のような事例は山のようにあるのが真理だと思います。しかしながらそのような報告をあまり聞かないなと思ったので質問させていただきました。解釈が複雑になるので敬遠されがちになるということでしょうか、、、
ただ、しっかり調べたわけではないので、探せば沢山あるかもかも知れません。

一応解決とさせていただきますが、表題のような事例をご存知の方がいらっしゃいましたら投稿いただけますと大変勉強になります。

(無題) 削除/引用
No.9420-6 - 2021/01/09 (土) 09:29:02 - おお
まあ想像の上だけだと、circadian rhythm関連の遺伝子だと、KDやKOしてもOEでもcircadian rhythmが狂いそうだし、複数のSubunitsのコンプレックスで機能するものだと、その一つの遺伝子をKD、KOすると機能を失うだろうけどOEでも不完全なComplexができるわけで機能が発揮できない可能性もありそう。

(無題) 削除/引用
No.9420-5 - 2021/01/09 (土) 04:18:04 - おお
Knockdown and overexpression of Unc-45b result in defective myofibril organization in skeletal muscles of zebrafish embryos
PMID: 20849610 PMCID: PMC2954953

Overexpression and knockout of miR-126 both promote leukemogenesis
PMCID: PMC4616234 PMID: 26361793

Both decreased and increased SRPK1 levels promote cancer by interfering with PHLPP-mediated dephosphorylation of Akt
PMID: 24703948 PMCID: PMC4019712

(無題) 削除/引用
No.9420-4 - 2021/01/09 (土) 03:48:12 - おお
例は思いつかないけど、そりゃあるでしょ。生物だもん

(無題) 削除/引用
No.9420-3 - 2021/01/09 (土) 01:47:22 - BlueComma
個体レベルの方がよりありがたいですが、細胞レベルでの現象でも情報があると嬉しいです。

(無題) 削除/引用
No.9420-2 - 2021/01/09 (土) 01:29:42 - おお
動物(マウス)レベルのはなしですか?それとも細胞レベルの話ですか?

遺伝子の過剰発現とノックアウトで表現型が同じ事例 削除/引用
No.9420-1 - 2021/01/09 (土) 01:00:47 - BlueComma
いつも勉強させていただいております。

表題のとおりです。過剰発現の表現型と遺伝子ノックアウトの表現型が同じになるケースってあるのでしょうか?ご存知の方がいらっしゃいましたらご教授いただけますと幸いです。

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