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Clontech社のSMART II A Oligo トピック削除
No.127-TOPIC - 2009/03/03 (火) 15:00:47 - 旅のカラス
表題キットについての質問です。

RACEにおいて、Clontech社のSMART RACE cDNA Amplicifation Kitを用いることになったのですが、Kitの中でSMART II A Oligoが使い切られてしまっていました。そこで困ったのですが、SMART II A Oligoの配列は公開されているので、これを元にprimerと同様に合成依頼をかけてもいいかと考えました。ただ、SMART II A Oligoは説明書に-70℃保管と書いてありますし、特殊な修飾などがかかっており、単に合成しただけでは意味がないのかとも感じています。どなたか、同様のことを試された方がいらっしゃいましたらお教え願えれば幸いです。また、原理についてコメント頂けても助かります。
どうぞ宜しくお願いします。
 
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アドバイス感謝致します 解決済み 削除/引用
No.127-4 - 2009/03/04 (水) 09:39:10 - 旅のカラス
中年さん、Pumpkinさん、アドバイスありがとうございます。
中年さんご紹介のトピで、-70℃保管が必要な理由が分かった(?)気がします。精製法に気をつけて、一度取りあえず試してみます。Pumpkinさんが仰有るように、プライマー量がこのキットのネックですね。場合によっては、合成品と正規品を混合プライマーとして用いてそれなりの収率が得られれば…とも思います。

(無題) 削除/引用
No.127-3 - 2009/03/03 (火) 16:37:13 - Pumpkin
ClontechのSMARTシリーズを重用していますが、このキットの欠点はトピ主さんの質問にあるように、キットの初めの段階で用いるプライマー類の少なさにあります。他えば7回分だとすると、1uL/1回で総量7uLしか入っていないというシビアさです。4年生とか実験になれていない者がつかうと悲惨です。

で、プライマーですがCDSプライマーは自作で使ったことがあります(あまり大きな声ではいえませんが)。ただし、精製度はHPLC精製以上でやりました。問題ありません。しかし、ご質問にあるSMART 2A オリゴは特別修飾されている趣旨が確かにどこかにあり、どうかなと思います。私は幸い、SMART 2A オリゴが不足する局面にありませんが、とにかく作製して結果を見比べてみてはいかがでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.127-2 - 2009/03/03 (火) 15:09:15 - 中年
昔々、その昔、こんなトピックがありました。

http://www.kenkyuu.net/cgi-biotech/biotechforum.cgi?mode=view;Code=3314

Clontech社のSMART II A Oligo 削除/引用
No.127-1 - 2009/03/03 (火) 15:00:47 - 旅のカラス
表題キットについての質問です。

RACEにおいて、Clontech社のSMART RACE cDNA Amplicifation Kitを用いることになったのですが、Kitの中でSMART II A Oligoが使い切られてしまっていました。そこで困ったのですが、SMART II A Oligoの配列は公開されているので、これを元にprimerと同様に合成依頼をかけてもいいかと考えました。ただ、SMART II A Oligoは説明書に-70℃保管と書いてありますし、特殊な修飾などがかかっており、単に合成しただけでは意味がないのかとも感じています。どなたか、同様のことを試された方がいらっしゃいましたらお教え願えれば幸いです。また、原理についてコメント頂けても助かります。
どうぞ宜しくお願いします。

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