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DNA解析のフリーウェア(MacOSX10.3.9対応)探しています トピック削除
No.291-TOPIC - 2009/04/07 (火) 12:05:57 - ゆう
この春から職場が変わり、これまでに利用していた有償のDNA解析ソフト(MacVector)が使用出来なくなりました。
新しい職場で利用するための、DNA解析用のフリーウェアを探しています。

「CLC Sequence Viewer」が使い勝手が良いと聞いたので、最新版ver6.0.2をダウンロードしたのですが、MacOSX10.3.9ではJAVAが対応しておらず、OSをアップデートするように注意がでました。
既に、インストール済みの他のソフトウェアの関係もあって、OSのアップデートは避けたいと考えています。

旧verなら、MacOSX10.3.9にも対応しているかと思い、web上で旧verの検索をしてみたのですが、旧verを落とせそうなsiteは見つかりませんでした。

MacOSX10.3.9で動作可能な、良いDNA解析用フリーウェアを教えて頂けないでしょうか?
 
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DNA解析のフリーウェア(MacOSX10.3.9対応)探しています 削除/引用
No.291-8 - 2009/04/30 (木) 18:29:54 - ゆう
> IdentityX さま
リンク先ページ拝見させて頂きました。
生物種間での遺伝子やタンパク質の相同性のチェック、
及びシーケンス断片のアライメント等が出来れば良いと考えています。
OS10.3.9の動作環境は一度ダウンロードして試してみたいと思います。
情報ありがとうございました。

(無題) 削除/引用
No.291-7 - 2009/04/30 (木) 14:02:27 - IdentityX
やりたいことが良く分からないのですが、アライメントした複数の配列を扱うのであれば IdentityX
http://home.hiroshima-u.ac.jp/kei/IdentityX/index.html
がお勧めです。
OS 10.4 推奨となっているので、 10.3.9 で動くかどうかは分かりません(ごめんなさい)。

DNA解析のフリーウェア(MacOSX10.3.9対応)探しています 削除/引用
No.291-6 - 2009/04/08 (水) 11:31:26 - ゆう
皆様、ありがとうございました。

>TK-1, APさま
VectorNTIの存在は知っていたのですが、
通りがかりさまが仰っているようにフリーのサービスが終了していると
思い、諦めました。

>APさま
ApEは知らなかったので、サイトを検索して見つけました。
情報ありがとうございます。
試してみたいと思います。

>通りすがりさま
やっぱりVectorNTIは無償使用は不可なんでしょうね。
旧verであれば、可能なのかなとも思ったのですが、インビトロジェンが管理しているとなるとそれも難しいと思いCLCを探し始めました。

>お助けさま
有り難うございます。
CLC Free Workbenchでヒットしました。
また、昨日も色々と検索を掛けていて、
CLCSequenceViewer 4.6.2 for Macというのも見つけました。
これだとOSX10.3でも動きそうであるので、ApEと比較してみようと思っています。

(無題) 削除/引用
No.291-5 - 2009/04/07 (火) 21:21:52 - お助け
古いバージョンもCLCのサーバーにあるよ。リンクは削除されてるので直リンURLを見つけないといけないけど。

ヒント:CLC Sequence Viewerは以前はCLC Free Workbenchという名前だった。

(無題) 削除/引用
No.291-4 - 2009/04/07 (火) 15:50:01 - 通りがかり
Vector NTI は昨年末に新バージョンが出るのに伴って、フリーライセンスの供与が終了しました。現時点で有効なライセンスがあれば使用可能ですが、1年間のライセンスが切れれば更新することはできません。

http://www.invitrogen.com/site/us/en/home/LINNEA-Online-Guides/LINNEA-Communities/Vector-NTI-Community/Vector-NTI/Support/frequently-asked-questions-answers.html

(無題) 削除/引用
No.291-3 - 2009/04/07 (火) 13:13:00 - AP
Vectorを使い慣れていて、OSX10.3ならVector NTIがぴったりではないでしょうか。Mac用の開発を中止してしまって、新しいOS向け、Intel Mac向けのヴァージョンが出ない状況ですが、開発最終バージョンは非商用・登録を条件にインビトロジェンから無償で提供されていたはずです。

http:// 削除/引用
No.291-2 - 2009/04/07 (火) 12:07:57 - TK-1
OS10.3ならVector NTIが使えると思います。Pantherでも使えるのなら、シンプルなApeもいいかと思います。

DNA解析のフリーウェア(MacOSX10.3.9対応)探しています 削除/引用
No.291-1 - 2009/04/07 (火) 12:05:57 - ゆう
この春から職場が変わり、これまでに利用していた有償のDNA解析ソフト(MacVector)が使用出来なくなりました。
新しい職場で利用するための、DNA解析用のフリーウェアを探しています。

「CLC Sequence Viewer」が使い勝手が良いと聞いたので、最新版ver6.0.2をダウンロードしたのですが、MacOSX10.3.9ではJAVAが対応しておらず、OSをアップデートするように注意がでました。
既に、インストール済みの他のソフトウェアの関係もあって、OSのアップデートは避けたいと考えています。

旧verなら、MacOSX10.3.9にも対応しているかと思い、web上で旧verの検索をしてみたのですが、旧verを落とせそうなsiteは見つかりませんでした。

MacOSX10.3.9で動作可能な、良いDNA解析用フリーウェアを教えて頂けないでしょうか?

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