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scion imageでの陽性細胞カウント トピック削除
No.2989-TOPIC - 2010/08/05 (木) 06:50:40 - image
 免疫染色したサンプルの中の陽性細胞をscion imageをつかってカウントしたいと思っています。Threshholdを設定して、analyze particlesでカウントするという一般的な方法です。
 以前したときには、カウントすると、細胞数とともに、画面上にそれぞれの細胞に対して番号がついて出てきていましたが、なぜか番号が表示されません。カウント細胞数はinfoの欄に正しく表示されています。番号が表示されないと、どの細胞をソフトウエアがカウントして、どの細胞をカウントしていないのかがわからないため次のステップに進めません。以前うまく表示されていたときとは使用しているパソコンが変わっていること以外は特にかえていません。
 何かソフトウエアの設定上、番号表記をつける設定があるのでしょうか。あるいは、どの細胞がカウントされているのかを知る手段が他にあるのでしょうか。教えていただければ喜びます。
 
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(無題) 削除/引用
No.2989-2 - 2010/11/08 (月) 10:36:42 - tom
もう解決されたかもしれませんが、Prticle Analysis OptionsのLabelParticleをチェックすれば、番号表示されますので、一度試してください。

scion imageでの陽性細胞カウント 削除/引用
No.2989-1 - 2010/08/05 (木) 06:50:40 - image
 免疫染色したサンプルの中の陽性細胞をscion imageをつかってカウントしたいと思っています。Threshholdを設定して、analyze particlesでカウントするという一般的な方法です。
 以前したときには、カウントすると、細胞数とともに、画面上にそれぞれの細胞に対して番号がついて出てきていましたが、なぜか番号が表示されません。カウント細胞数はinfoの欄に正しく表示されています。番号が表示されないと、どの細胞をソフトウエアがカウントして、どの細胞をカウントしていないのかがわからないため次のステップに進めません。以前うまく表示されていたときとは使用しているパソコンが変わっていること以外は特にかえていません。
 何かソフトウエアの設定上、番号表記をつける設定があるのでしょうか。あるいは、どの細胞がカウントされているのかを知る手段が他にあるのでしょうか。教えていただければ喜びます。

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