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SDS-PAGE終了時のゲル内pHは? トピック削除
No.3382-TOPIC - 2010/10/19 (火) 22:32:30 - 笑い男
 ちょっとした興味です。気軽に返信頂けると助かります。

Laemmliシステムで自作ゲルを作って
pH6.8の4xbufferで濃縮ゲルを
pH8.8の4xbufferで分離ゲルを
pH8.3の10xbuffer使って泳動をしたら・・・・

終了時に分離ゲル内のpH環境はどうなっていると思いますか?

ゲルの8.8に近いpH?泳動緩衝液の8.3に近いpH?
それともイオンが移動したことでpHは7とか9とかに振れてる?

 かってな想像で結構ですので気軽に書き込んでいただけますか?
 
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(無題) 削除/引用
No.3382-5 - 2010/10/21 (木) 02:38:08 - おお
今度流したあとにpHペーパーで測ってみましょうか、、、
あ、私のシステムはちょっと違うなぁ。。。

コメントありがとうございます 削除/引用
No.3382-4 - 2010/10/20 (水) 21:48:45 - 笑い男
 引き続き、いろんな意見を募集しています。


>[Re:2] amiさんは書きました :
> 9くらい?
 コメントありがとうございます。
 トリス頑張り派ですね!


>[Re:3] おおさんは書きました :
> >pH8.3の10xbuffer使って泳動をしたら・・・・
> 10倍こいバファーを故意に流してるってわけではないですよね、、、
 希釈しています。質問内容も気楽に書きすぎでしたね。申し訳ありません。

> グリシンがゲルに流れ込んでいくので下がっていくと思ってます。
> まあ相対濃度で変わってくるのでよく分からないですけどね。
> トリスは逆向きから供給されますし、、、
 えーっと、陽極側からグリシンはやってきて、陰極側からトリスは入ってくるし・・・・泳動前はゲル内に無かったグリシンが泳動終了時にはゲル内に存在するから、8.8よりは酸性にシフトするということですか?
 8.3より酸性側に振れるかどうかは・・・・グリシンの濃度は高いしなー・・・ 悩ましいなー

(無題) 削除/引用
No.3382-3 - 2010/10/20 (水) 01:04:54 - おお
>pH8.3の10xbuffer使って泳動をしたら・・・・
10倍こいバファーを故意に流してるってわけではないですよね、、、

グリシンがゲルに流れ込んでいくので下がっていくと思ってます。
まあ相対濃度で変わってくるのでよく分からないですけどね。
トリスは逆向きから供給されますし、、、

(無題) 削除/引用
No.3382-2 - 2010/10/20 (水) 00:07:51 - ami
9くらい?

SDS-PAGE終了時のゲル内pHは? 削除/引用
No.3382-1 - 2010/10/19 (火) 22:32:30 - 笑い男
 ちょっとした興味です。気軽に返信頂けると助かります。

Laemmliシステムで自作ゲルを作って
pH6.8の4xbufferで濃縮ゲルを
pH8.8の4xbufferで分離ゲルを
pH8.3の10xbuffer使って泳動をしたら・・・・

終了時に分離ゲル内のpH環境はどうなっていると思いますか?

ゲルの8.8に近いpH?泳動緩衝液の8.3に近いpH?
それともイオンが移動したことでpHは7とか9とかに振れてる?

 かってな想像で結構ですので気軽に書き込んでいただけますか?

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