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形質転換時のコンタミについて トピック削除
No.3443-TOPIC - 2010/10/30 (土) 08:37:18 - 1122
エレポでgDNAによる形質転換を行っています。
outgrowth終了した時点で顕微鏡によるコンタミはみられません。
しかし、ストレプトマイシン培地に菌を植菌・インキュベート、コロニーをいくつかピックアップし顕微鏡で観察すると、ブドウ球菌によるコンタミが多数見られます。
器具・ブロース・培地等の滅菌は完璧に行っています。
抗生物質濃度も適値だと考えます。
また、実験はベンチ上を簡易無菌状態にし行っています。
情報が少ないかもしれませんが、なにかお分かりの方、情報がありましたら
教えてください。
よろしくお願いします。
 
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(無題) 削除/引用
No.3443-5 - 2010/10/30 (土) 19:04:32 - 宗
よく分からないので聞きたいんですが、
・形質転換しようとしている生物はなんですか?大腸菌?
・その生物とブドウ球菌はコロニーでは見た目に差がないんですか?
・顕微鏡では結構見た目が違うものなんですか?

(無題) 削除/引用
No.3443-4 - 2010/10/30 (土) 17:15:36 - Actias
電気ではなく、野島法のコンピで失敗したことがある。

ヒートショック用に使った水が、マイクロチューブにくっついていて、それが入ってしまってコンタミした。

器具のちょっと外側にも敵が居ることをお忘れなく。

(無題) 削除/引用
No.3443-3 - 2010/10/30 (土) 11:19:36 - ~
一番気になるのは本当に貴方が顕微鏡でブドウ球菌を判別する能力があるかどうかです。
実はトラブルは起きていなかったりしませんか?
それすら、書かれている情報からでは確認できません。

また、実は引っかけ問題で、エレクトロポレーションした菌がブドウ球菌で、何一つおかしなところが無いというわけでもありませんよね?

まずは、
本当にコンタミしているのか
コントロールをおいて、どれがコンタミしているか。
を調べてみてはいかがでしょうか。
何も撒かずにインキュベートすれば、プレート(やインキュベーター)のコンタミは確認出来るでしょうし、形質転換していない菌やDNAをそれぞれ撒けば、それらのコンタミも確認できます。

>器具・ブロース・培地等の滅菌は完璧に行っています。
無理でしょう。
貴方が使っている滅菌装置で、指標菌を使って滅菌できていることを最後に確認したのはいつですか?
その確認以降にもその性能が維持できていることは、どのように示せますか?
そんな確認はしたことが無く、単にオートクレーブのスタートボタンを押して終了のランプを見ただけであれば、オートクレーブの故障等の可能性を否定できません。
ラボレベルの話でしょうから機械を信じるのはいいのですが、トラブルが起きているときには問題がおきていないかを確認する必要があるでしょう。

(無題) 削除/引用
No.3443-2 - 2010/10/30 (土) 10:04:10 - おお
>顕微鏡で観察すると、ブドウ球菌によるコンタミ

顕微鏡だけでどの程度確実なことがいえるの?

形質転換時のコンタミについて 削除/引用
No.3443-1 - 2010/10/30 (土) 08:37:18 - 1122
エレポでgDNAによる形質転換を行っています。
outgrowth終了した時点で顕微鏡によるコンタミはみられません。
しかし、ストレプトマイシン培地に菌を植菌・インキュベート、コロニーをいくつかピックアップし顕微鏡で観察すると、ブドウ球菌によるコンタミが多数見られます。
器具・ブロース・培地等の滅菌は完璧に行っています。
抗生物質濃度も適値だと考えます。
また、実験はベンチ上を簡易無菌状態にし行っています。
情報が少ないかもしれませんが、なにかお分かりの方、情報がありましたら
教えてください。
よろしくお願いします。

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