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(無題) 削除/引用 No.3498-2 - 2010/11/09 (火) 13:23:32 - Pumpkin >454の方がスピードが早い どのような比較から早いと結論付けられているのかが分かりません。トピ主さんがresequencingしたい生物種のゲノムサイズがどの程度なのか、そしてどのくらいのカバレッジがあれば十分と考えられているのか、これがわからないとアドバイスのしようがありません。 第二世代型のシークエンサーもそれぞれに一長一短があるわけですが、1runあたりのデータプロダクションの量から、十分なカバレッジが得られるには何runする必要があって、そのときの（時間的なコストも考えて）コストはいかほどなのかをもって結論付けられるべきかと思います。 その考えをもって、受託会社と相談するのが良いでしょう。どちらの機械もお持ちであれば、上司もしくはオペレーターと相談するのが良いでしょう

Paired-end resequencingの次世代シークエンサーの選び方 削除/引用 No.3498-1 - 2010/11/09 (火) 03:50:01 - 留学生 いつも勉強させていただいています。 質問なのですが、 もし、Paired-end resequencingをして個体間でのstructural variationを調べたい場合に、454 (Roche)を使うべきか、genome analyzer (Illumina)を使うべきか迷っています。 454の方がスピードが早いとは聞くのですが、その他に利点がありましたら、教えていただきたいです。 よろしくお願いします。

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