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酵母のコロニーPCR トピック削除
No.351-TOPIC - 2009/04/18 (土) 09:53:37 - ひがし
酵母のコロニーPCRがうまくいきません。
0.25%のSDS(20μl)にコロニーから取った菌体をけん濁し、180μlのDWを加えて遠心した上清を1μlとってPCRの基質にしています。SDSけん濁液をboilしてもだめでした。コロニーは2ヶ月ほど前の古いものです。よい方法があればご教示お願いします。
 
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No.351-5 - 2009/04/19 (日) 10:26:17 - ひがし
みなさん、ありがとうございました。
菌体の量も重要なようですね。
フレッシュな菌でやってみます。

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No.351-4 - 2009/04/18 (土) 15:11:06 - aimar
菌体を多くけん濁しすぎるとダメなことが多いです。
心配になるくらいほんとに少しでもいけます。
 
僕はピペットのチップの先で酵母をつついて薄いNaOH溶液(10mM, 100µl)に酵母をけん濁して、37℃5min。遠心後上清の1µlをゲノムDNAとして使います。

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No.351-3 - 2009/04/18 (土) 11:22:34 - ひがし
さっそくのレスありがとうございます。
プライマーはワークします(ベクターで確認済み)。

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No.351-2 - 2009/04/18 (土) 10:33:26 - おお
直接コロニーをチップとか爪楊枝でつついて、PCRミックスにつけるだけで
いけるとおもうけどなぁ、、、、

プライマーはプラスミドを直接使った場合ワークしますか?

二カ月だと古くなってダメになっている可能性もあるので、線画培養しなおした方がいいでしょうけど,,,,

酵母のコロニーPCR 削除/引用
No.351-1 - 2009/04/18 (土) 09:53:37 - ひがし
酵母のコロニーPCRがうまくいきません。
0.25%のSDS(20μl)にコロニーから取った菌体をけん濁し、180μlのDWを加えて遠心した上清を1μlとってPCRの基質にしています。SDSけん濁液をboilしてもだめでした。コロニーは2ヶ月ほど前の古いものです。よい方法があればご教示お願いします。

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