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loxP配列の中のATG トピック削除
No.3522-TOPIC - 2010/11/15 (月) 15:43:30 - loxp
loxPの塩基配列の中にはATGがあります。
よって、ある遺伝子のコザック配列の上流にloxPが存在した場合、loxPのATGから翻訳がスタートすると考えるべきでしょうか?
現在、コンストラクト作製のやり直し(loxPを逆向きにする)をしたほうがいいのではと不安に駆られています。
 
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勉強になりました。少し安心しています。 削除/引用
No.3522-3 - 2010/11/16 (火) 09:03:17 - loxp
Actiasさん、貴重なコメントどうもありがとうございます。

目的遺伝子が70〜80%翻訳されさえすれば、私の実験ではほとんど問題にならないと考えています。
Actiasさんのコメントを読んで、このまま(やり直さずに)で大丈夫なのではないかという気がしてきました。
ちなみに、今後このコンストラクトを用いてTgマウスを作製する予定です。

(無題) 削除/引用
No.3522-2 - 2010/11/15 (月) 21:52:11 - Actias
条件がそろえば、無いとはいえない。

要求する実験のレベル
loxPのATGからは決して翻訳されてはならない
目的遺伝子のATGから翻訳されるなら気にしない
により、どうするかが決まります。

ちなみに、loxP中の配列が、TATAになり得ます。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15240889

loxP配列の中のATG 削除/引用
No.3522-1 - 2010/11/15 (月) 15:43:30 - loxp
loxPの塩基配列の中にはATGがあります。
よって、ある遺伝子のコザック配列の上流にloxPが存在した場合、loxPのATGから翻訳がスタートすると考えるべきでしょうか?
現在、コンストラクト作製のやり直し(loxPを逆向きにする)をしたほうがいいのではと不安に駆られています。

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