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ChIPのソニケーションでサンプルが泡立ちます トピック削除
No.3537-TOPIC - 2010/11/17 (水) 18:33:31 - ChIP子
ChIPのソニケーションでサンプルが泡立ってしまいます。
30秒ON、30秒OFFで30回ソニケーションを行っていたのですが、6セット目でサンプルが泡立ちます。
何回かやった時には、泡立たないが2度程ありました。サンプルが泡出つときと泡立たないときの違いがわかりません。
また、サンプルが泡立つとタンパク質の構造が破壊される可能性があるといわれていますが、結果にどのくらい影響しますか？
もしよろしければ、ご指導、ご鞭撻のほどよろしくお願い致します。
　
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(無題) 削除/引用
No.3537-2 - 2010/11/17 (水) 22:43:58 - み
Bioruptorまたは、その類似品ですか？

15ml-size遠沈管を使用する際、中心棒が液にじゅうぶん浸ってないとか。回数を増すごとに液が少しずつ飛び散り、液量が減っていって、中心棒の先が液から顔を出す時に泡立つことが考えられます。

エッペンドルフチューブをBioruptorで行う際にはそのような経験は無いです。

詳しい事が書かれてないので的外れかも。

ChIPのソニケーションでサンプルが泡立ちます 削除/引用
No.3537-1 - 2010/11/17 (水) 18:33:31 - ChIP子
ChIPのソニケーションでサンプルが泡立ってしまいます。
30秒ON、30秒OFFで30回ソニケーションを行っていたのですが、6セット目でサンプルが泡立ちます。
何回かやった時には、泡立たないが2度程ありました。サンプルが泡出つときと泡立たないときの違いがわかりません。
また、サンプルが泡立つとタンパク質の構造が破壊される可能性があるといわれていますが、結果にどのくらい影響しますか？
もしよろしければ、ご指導、ご鞭撻のほどよろしくお願い致します。
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