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タンパク質を溶かすバッファ トピック削除
No.3799-TOPIC - 2011/01/11 (火) 13:45:33 - lyuolyuo
非常に初歩的な質問で申し訳ないのですが、みなさんはタンパク質を溶かすバッファとそのバッファに溶かした際の安定性をどのように判断していらっしゃるのでしょうか?
個々の論文以外でもしそのようなデータベースがあれば教えていただきたいです。
 
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No.3799-6 - 2011/01/18 (火) 19:41:40 - lyuolyuo
atsさん、~さんご回答ありがとうございます。
とりあえずもう少し文献を当たってみようかと思います。
なければ自分で安定性評価も考えてみようと思っています。

一覧表は見つかったらラッキーくらいに思ったほうが 削除/引用
No.3799-5 - 2011/01/14 (金) 13:39:09 - ~
目的だけでなく、タンパク質によっても使えるバッファーは変わるでしょうね。(特にpH)
酵素であれば、活性測定に保存液の組成が影響する場合もあるでしょう。

たまに、何でこんな情報をまとめているんだろうというサイトを見かけたりしますが、そんなサイトを探し続けるよりも、バッファーは自分で文献等を見て、安定性も自分で測定したほうが早いと思います。

(無題) 削除/引用
No.3799-4 - 2011/01/14 (金) 11:38:21 - ats
レスが少ないようなので。。
どのような目的に使うかによって溶液組成は変わるのでデータベースは作成しづらいでしょう。
酵素学の教科書が参考になると思います。私なら先例を参考に以下から選びます。
pH調整:Tris, HEPES, リン酸、酢酸、クエン酸、炭酸, ....(10~50mM)
塩:NaCl, KCl, (NH2)2SO4, .... (50~150mM)
(上記は濃縮を考えて他の揮発性のものを選んだり、培地に添加するため浸透圧・毒性を考慮するときもあります。精製途中ならカラムとの相性も考慮します。)
補因子・補酵素:Mg, Ca, Zn, NAD(P), ATP, ... (0.01~1mM)
酸化防止剤:DTT, bME (1~10mM)
安定剤:glycerol, Triton X-100, BSA, sucrose, trehalose, EGTA, EDTA, Protease Inhibitors

安定性の評価は難しいですね。活性が測定できるなら評価しやすいでしょうけど。

(無題) 削除/引用
No.3799-3 - 2011/01/14 (金) 10:48:52 - lyuolyuo
貴重なご意見ありがとうございます。参考にさせていただきます。

そのような酵素とバッファの一覧表のようなものがあれば便利だとは思いますが、そのようなものがあるのでしょうか?

タンパク質のデータベース等をあさって見てはいるんですが、自分の力では未だに見つけられていません。もしご存知でしたら教えていただけると幸いです。

(無題) 削除/引用
No.3799-2 - 2011/01/11 (火) 14:21:43 - ~
バッファーは先例を見て選択し、
安定性は適当なカラムを通した後の吸光ピークかELISAの発色で判断しています。
(活性までは見ていません)

求めているのはその様な情報ではなく、タンパク質とバッファーの組合せによる安定性の一覧表のようなものでしょうか?

タンパク質を溶かすバッファ 削除/引用
No.3799-1 - 2011/01/11 (火) 13:45:33 - lyuolyuo
非常に初歩的な質問で申し訳ないのですが、みなさんはタンパク質を溶かすバッファとそのバッファに溶かした際の安定性をどのように判断していらっしゃるのでしょうか?
個々の論文以外でもしそのようなデータベースがあれば教えていただきたいです。

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