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(無題) 削除/引用 No.3804-4 - 2011/01/12 (水) 13:45:28 - Pumpkin カラムを使っていないとなると、5S, tRNAなどが考えられます。nanaさんがご指摘のように、tRNAの線が濃厚だと思いますが、5Sが見られないということはないと思うので、電気泳動ゲルの濃度によっては5SやらtRNAやらが分離せずに1バンドとして確認されているのではないかと思います。 RNAが分解している時には、スメア状やいくつものバンドが確認できるようになるので、total RNAを適正量電気泳動したときに23S, 16S, 5S(tRNA)のバンドがビシッと見られ、かつスメアがなければ良いのではないでしょうか（カラムを使えば、tRNAの量は激減しますが）。個人的にはbioanalyzerでの検定をお勧めしますが、実験によっては、スメアのあるなしで分解度を判定しても問題ないと思います。

(無題) 削除/引用 No.3804-3 - 2011/01/12 (水) 08:48:35 - nana tRNAではないのですか？

(無題) 削除/引用 No.3804-2 - 2011/01/12 (水) 06:09:55 - AP BPBの蛍光だったりしませんか？

RNA泳動バンドについて 削除/引用 No.3804-1 - 2011/01/11 (火) 21:37:34 - はやし 細菌からRNA抽出をしています。 抽出後のRNAを泳動すると16s、23sのバンドが見えるのですが、 これら２本のバンドの何倍もの光強度で、500bp以下にバンドが1本みえます。 このバンドは何に由来するものでしょうか？ RNAの分解産物かと考えたのですが、 16sと23sのバンド比はむしろ23sの方が濃くでています。 5srRNAにしてはバンドが濃すぎるように思います。 RNA抽出はISOGENという試薬を使い、カラムを用いない方法で行っています。 RNA抽出後、DNase I処理を行い、フェノクロ処理、クロロホルム処理を行い、 溶出しています。 アドバイス頂けると助かります。 よろしくお願い致します。

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