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可能な限り短いプロモーター トピック削除
No.457-TOPIC - 2009/05/13 (水) 02:00:50 - よっしー
遺伝子発現プロモーターで、できるだけ短いものを探しています。
50〜100bp辺りで哺乳細胞のプロモーターが理想ですが、哺乳細胞でなくてもかまいません。
どなたかご存知の方いらっしゃいましたら教えていただきたいです。よろしくお願いします。
 
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No.457-5 - 2009/05/14 (木) 07:47:33 - 通りがかり
意図していることにあっているかわかりませんが、
例えばluciferase assayで使うようなベクターの
プロモータは短いものがあります。

例えば、プロメガのpGL4のminimal promoter(miniP)は
添付文書に配列が書いてありますが、30bp程度です。
pGL4.23等は持っていないので、
実際にどの細胞で動く/動かない、はわかりません。

(無題) 削除/引用
No.457-4 - 2009/05/13 (水) 14:56:55 - よっしー
ありがとうございます。
NeuroDやbHLH関係の論文をあたってみます。
また載せていただいた論文も参考にさせてもらいました。

まだまだ初心者なのでわからないことばかりですが、頑張ってみます。

(無題) 削除/引用
No.457-3 - 2009/05/13 (水) 10:30:41 - ~
http://www.abbs.info/pdf/41-04/07.pdf
で書かれているのは一応160bpですね。
上流側のGC boxぎりぎりまで削っても転写活性がある気がします。

プロモーターのデリーションミュータントを作っている論文で、
100bp以下にまで削っている論文を当たるのがいいと思います。

(無題) 削除/引用
No.457-2 - 2009/05/13 (水) 06:23:52 - おお
100位ならあったような気がしますが具体的には思い出せたいです。
メインに調べたことがあるのはNeuroDとかのbHLHのプロモーター
とかだったので、そのあたりと思います。
所で、エンハンサーをプロモーター下流に持っていけば、
プロモーター上流の長さを短くできると思いますがどうでしょうか。

可能な限り短いプロモーター 削除/引用
No.457-1 - 2009/05/13 (水) 02:00:50 - よっしー
遺伝子発現プロモーターで、できるだけ短いものを探しています。
50〜100bp辺りで哺乳細胞のプロモーターが理想ですが、哺乳細胞でなくてもかまいません。
どなたかご存知の方いらっしゃいましたら教えていただきたいです。よろしくお願いします。

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