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リン酸化タンパク質のプロテインアレイ トピック削除
No.707-TOPIC - 2009/06/19 (金) 23:36:27 - TS
いつも勉強させてもらっています。

現在、ある物質が、短時間で細胞に引き起こす作用を解明する一環として、
プロテインアレイを用い、リン酸化タンパク質の変化を網羅的にスクリーニング的解析ができないかと考えています。(具体的な物質名、作用を記載できなくて申し訳ありません)

Webでそれなりに探してみたのですが、タンパク質リン酸化に注目したようなプロテインアレイを見つけられません。(タンパク質発現量を解析するものは多数あるのですが、作用が短時間(20分以内)で認められるため、タンパク質発現量の変化は重要ではないと考えています)

シグナル伝達分子を中心に解析できたらと思っていますが、それ以外でも検討したいと思っています。

ご存じ、あるいはおすすめのアレイがありましたら、ご紹介して頂けないでしょうか?

ちなみに、動物種はラットです。
よろしくお願いします。
 
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PepChip追加 削除/引用
No.707-9 - 2010/12/27 (月) 21:40:01 - 葉
リン酸化の基質としてペプチドをマウントしたスライドに、
ライセートとラベルしたATPを混ぜてインキュベートして検出、みたいです。

(無題) 削除/引用
No.707-8 - 2010/12/27 (月) 13:59:02 - 葉
今読みかけの論文で、
PepChip kinase slide(PepScan system, オランダ)
を使っているようです。
ググってみてください。

論文じゃ原理がわからないのですみません。
でも、A処理とB処理でリン酸化されるスポットがどうこう、と比較してます。

(無題) 削除/引用
No.707-7 - 2010/12/24 (金) 11:46:56 - おじさん
フィルジェンという会社では、リン酸化の抗体アレイも販売している様ですよ。
http://www.filgen.jp/Product/Bioscience24-fullmoon/index4.htm

網羅的リン酸化解析 削除/引用
No.707-6 - 2009/09/10 (木) 16:51:33 - ものしり
上記にもあったフィルジェンという会社で、1318個のタンパク質のリン酸化を検出できる抗体アレイの受託をやっていますよ。
http://www.filgen.jp/Product/Bioscience24-fullmoon/index3.htm
iTRAQという安定同位体で質量分析をして、網羅的にリン酸化の部位の同定と相対的な定量も行っている様ですよ。
http://www.filgen.jp/Product/BioScience22-MS/index3.htm

(無題) 削除/引用
No.707-5 - 2009/06/21 (日) 01:21:31 - へいる
ここは?
見たいものによって選択するようです。どこのラボか知りませんが、日本からもオーダーできるはずです。

http://www.kinexus.ca/

(無題) 削除/引用
No.707-4 - 2009/06/20 (土) 21:50:13 - 中年
それほど包括的なものではありませんが、例えば次に挙げられているものなどはいかがでしょうか。受託サービス以外にアレイの販売もやっているところもあるようです。

http://www.filgen.jp/Product/Bioscience4/indexmenu.htm

(無題) 削除/引用
No.707-3 - 2009/06/20 (土) 18:09:31 - TS
中年さま:
そのとおりです。抗体アレイを探しています。
誤った書き方ですみません。よろしくお願いします。

(無題) 削除/引用
No.707-2 - 2009/06/20 (土) 16:03:15 - 中年
プロテインアレイとは多数のタンパク質をスポットしたものだと思われますが、それを使って細胞におけるタンパク質発現量(あるいはタンパク質リン酸化レベル)をどうやって評価するのでしょうか。あるいは抗体アレイのことを仰っているのですか。

リン酸化タンパク質のプロテインアレイ 削除/引用
No.707-1 - 2009/06/19 (金) 23:36:27 - TS
いつも勉強させてもらっています。

現在、ある物質が、短時間で細胞に引き起こす作用を解明する一環として、
プロテインアレイを用い、リン酸化タンパク質の変化を網羅的にスクリーニング的解析ができないかと考えています。(具体的な物質名、作用を記載できなくて申し訳ありません)

Webでそれなりに探してみたのですが、タンパク質リン酸化に注目したようなプロテインアレイを見つけられません。(タンパク質発現量を解析するものは多数あるのですが、作用が短時間(20分以内)で認められるため、タンパク質発現量の変化は重要ではないと考えています)

シグナル伝達分子を中心に解析できたらと思っていますが、それ以外でも検討したいと思っています。

ご存じ、あるいはおすすめのアレイがありましたら、ご紹介して頂けないでしょうか?

ちなみに、動物種はラットです。
よろしくお願いします。

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