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λファージのCIリプレッサー領域 トピック削除
No.780-TOPIC - 2009/07/01 (水) 18:25:21 - きゅうり
いつもお世話になっております。

λファージのCIリプレッサー領域をPCRでクローニングしたいのですが、NEBで売られているファージDNAはλcI857ind1 Sam7という非溶原性(CIリプレッサー領域に変異が入っている)から抽出されたもので使うことができません。どなたか、CIリプレッサー領域に変異の入っていないλファージまたはそのDNAを購入できるところをご存知ではないでしょうか?

よろしくお願いいたします。
 
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No.780-7 - 2009/07/02 (木) 14:02:01 - AP
>Lambda gt10ですか、久しぶりに聞きましたね(実物は手にしたことありません)。

気がつかなかったけれど、いま売ってないんですね。AmershamとかPharmaciaとか(合併して吸収されて跡形もないですが)、プロメガとか、多くのメーカーで扱われていたんですが。歳がばれそうですが、当時使っていたあまりが(特にコントロール用のintactなやつなんか)どっかのフリーザーで眠っているような。

代案として、
宿主菌の中にはlambda phageをlysogenとして保持しているものがあります。たとえばBL21(DE3)など。lysogenでもcIにmutationを持つものもあるようですが、その場合は遺伝子型が書いてあると思うので、BL21(DE3)のは大丈夫じゃないかな(なんたって現に溶原化してるんだから)。
ttp://www.brc.riken.go.jp/lab/dna/search/allhost.html

(無題) 削除/引用
No.780-6 - 2009/07/02 (木) 13:24:20 - きゅうり
>[Re:4] Pumpkinさんは書きました :
> Lambda gt10ですか、久しぶりに聞きましたね(実物は手にしたことありません)。どこかでまだ売っているといいのですが、どうでしょうか。gt11はストラタとかでまだ売っていますが、cI857ですしねぇ。Lambda gt10で作ったライブラリーなんかを手に入れられれば、PCRで切り出せるのですが。
>
> んー、温度感受性がどうのってかいてあるけど、こんなのはだめですか。
> http://www.stratagene.com/products/displayProduct.aspx?pid=383
>
> やっぱ、ファージはストラタかクロンテック(もうあまりあつかってないけど)とかノバジェンでしょうか。


ありがとうございます。ストラタジーン、クロンテック、ノバジェンのサポートに聞いてみます。

(無題) 削除/引用
No.780-5 - 2009/07/01 (水) 21:33:53 - Pumpkin
すいません、テンプレート用途としてはあまりに法外なお値段でした。

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No.780-4 - 2009/07/01 (水) 21:25:48 - Pumpkin
Lambda gt10ですか、久しぶりに聞きましたね(実物は手にしたことありません)。どこかでまだ売っているといいのですが、どうでしょうか。gt11はストラタとかでまだ売っていますが、cI857ですしねぇ。Lambda gt10で作ったライブラリーなんかを手に入れられれば、PCRで切り出せるのですが。

んー、温度感受性がどうのってかいてあるけど、こんなのはだめですか。
http://www.stratagene.com/products/displayProduct.aspx?pid=383

やっぱ、ファージはストラタかクロンテック(もうあまりあつかってないけど)とかノバジェンでしょうか。

(無題) 削除/引用
No.780-3 - 2009/07/01 (水) 18:58:26 - AP
cDNA libraryを作るときに、Hflのホストで非組換え体を排除する(プラーク形成さない)ような選択が可能な系では、原理的にcI+のラムダファージベクターを使います。代表的なのはlambda gt10。ほかにもHflのホストが推奨されている、あるいは添付されて販売されているファージベクターならokでしょう。

(無題) 削除/引用
No.780-2 - 2009/07/01 (水) 18:57:47 - Pumpkin
う〜ん、私は見たことないですね。そもそもcIが失活しているからこそプラークとして認識できてライブラリースクリーニングできるわけですから。

例えばTaKaRaさんとかで売ってるLambdaもcI857ind1 Sam7です。例えばLambdaじゃなくてもいいんですか?

あ、Lambdaでと書いてありましたね。失礼しました。

λファージのCIリプレッサー領域 削除/引用
No.780-1 - 2009/07/01 (水) 18:25:21 - きゅうり
いつもお世話になっております。

λファージのCIリプレッサー領域をPCRでクローニングしたいのですが、NEBで売られているファージDNAはλcI857ind1 Sam7という非溶原性(CIリプレッサー領域に変異が入っている)から抽出されたもので使うことができません。どなたか、CIリプレッサー領域に変異の入っていないλファージまたはそのDNAを購入できるところをご存知ではないでしょうか?

よろしくお願いいたします。

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