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shRNAのループ配列 トピック削除
No.94-TOPIC - 2009/02/25 (水) 15:17:18 - あべちゃん
shRNAのループ配列ですが
5'-TCAAGAG-3'
といった配列を模して、コンストラクトしてました。
このループ配列内に制限酵素サイトを入れれば、シーケンスを読むのも楽だろうし、そもそもクローンを取るときも便利だなと思ったのですが、

ループ配列にこのような細工をほどこしたりしている方いらっしゃいますか？

それとも、ループ配列というのは、あまり変えない方が良いのでしょうか？
　
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(無題) 削除/引用
No.94-3 - 2009/02/26 (木) 12:29:09 - あべちゃん
>[Re:2] ~さんは書きました :
> sigmaで売られているshRNA plasmidはloopがXhoI siteそのものになっています。
> いくつか使ったことがありますが、そこそこ抑えてくれるので問題ないのではないでしょうか。

~さん、
情報を頂きありがとうございました。Xho1ですか。参照させてただ来ます。

(無題) 削除/引用
No.94-2 - 2009/02/26 (木) 11:53:51 - ~
sigmaで売られているshRNA plasmidはloopがXhoI siteそのものになっています。
いくつか使ったことがありますが、そこそこ抑えてくれるので問題ないのではないでしょうか。

shRNAのループ配列 削除/引用
No.94-1 - 2009/02/25 (水) 15:17:18 - あべちゃん
shRNAのループ配列ですが
5'-TCAAGAG-3'
といった配列を模して、コンストラクトしてました。
このループ配列内に制限酵素サイトを入れれば、シーケンスを読むのも楽だろうし、そもそもクローンを取るときも便利だなと思ったのですが、

ループ配列にこのような細工をほどこしたりしている方いらっしゃいますか？

それとも、ループ配列というのは、あまり変えない方が良いのでしょうか？
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