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Accession Noの変換方法 トピック削除
No.431-TOPIC - 2010/11/11 (木) 15:28:56 - 素人です
素人ですいませんが、質問させてください。LC-MS/MSで蛋白の同定をしました。sequestのdata baseを使って解析したところ、gi119578453のようなaccession Number が得られました。このaccession numberのうち、giを除いた数字の部分をNCBIのproteinサイトに入力すると蛋白の説明にいくことができました。そこで網羅的にgene ontology を調べるために、DAVIDのサイトでこれらのaccession numberを張り付けてみたところ、accession numberを受け入れてくれず、numberの変換を求められています。UniprotというサイトでGI numberの変換がうまくいくと聞いてやってみたのですが、だめでした。どなたかぜひともsequestのdata baseのGI accession numberから、DAVIDが受け入れてくれるGI numberへの変換をご存じの方がおられましたらご教示願います。
 
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(無題) 削除/引用
No.431-2 - 2010/11/24 (水) 06:28:24 - ンンノ
これ、解決してるんですよね?

マルチで投稿するなとかうるさいことは指摘したくないんですが、このまま
放っておくと将来に誰かが回答をつけるかもしれません。
解決済みなら、その厚意を無駄にすることになるので失礼ですよ。

Accession Noの変換方法 削除/引用
No.431-1 - 2010/11/11 (木) 15:28:56 - 素人です
素人ですいませんが、質問させてください。LC-MS/MSで蛋白の同定をしました。sequestのdata baseを使って解析したところ、gi119578453のようなaccession Number が得られました。このaccession numberのうち、giを除いた数字の部分をNCBIのproteinサイトに入力すると蛋白の説明にいくことができました。そこで網羅的にgene ontology を調べるために、DAVIDのサイトでこれらのaccession numberを張り付けてみたところ、accession numberを受け入れてくれず、numberの変換を求められています。UniprotというサイトでGI numberの変換がうまくいくと聞いてやってみたのですが、だめでした。どなたかぜひともsequestのdata baseのGI accession numberから、DAVIDが受け入れてくれるGI numberへの変換をご存じの方がおられましたらご教示願います。

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