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クラスタリングの条件について トピック削除
No.541-TOPIC - 2017/06/28 (水) 17:13:25 - いきものがかり
自分は抗肥満の研究を行なっており,現在MeVを用いた階層的クラスタリングで距離法と連結法について条件を迷っております.

クラスタリングを行う目的が,
通常食,通常食+抗肥満薬品,高脂肪食,高脂肪食+抗肥満薬品のうち,
薬品を投与することで変化した代謝物の変動に大まかに検討をつけたいです.

距離法が
Euclidian Distance
Manhattan Distance
Pearson correlation
Pearson uncorrelation
Pearson squarred
Covariance method
Spearman rank method
とあって,どれを選べば良いのでしょうか?

また,連結法についてですが,
Average linkage clustering
Complete linkage clustering
Single linkage clustering
とあって,どれを選ぶ必要があるのでしょうか?

選択の理由もお聞かせいただけたら幸いです.
 
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クラスタリングの条件について 削除/引用
No.541-1 - 2017/06/28 (水) 17:13:25 - いきものがかり
自分は抗肥満の研究を行なっており,現在MeVを用いた階層的クラスタリングで距離法と連結法について条件を迷っております.

クラスタリングを行う目的が,
通常食,通常食+抗肥満薬品,高脂肪食,高脂肪食+抗肥満薬品のうち,
薬品を投与することで変化した代謝物の変動に大まかに検討をつけたいです.

距離法が
Euclidian Distance
Manhattan Distance
Pearson correlation
Pearson uncorrelation
Pearson squarred
Covariance method
Spearman rank method
とあって,どれを選べば良いのでしょうか?

また,連結法についてですが,
Average linkage clustering
Complete linkage clustering
Single linkage clustering
とあって,どれを選ぶ必要があるのでしょうか?

選択の理由もお聞かせいただけたら幸いです.

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