>[Re:1] あかねさんは書きました :
> 現在大量のBLAST検索を頻繁に行っていますが、
> On lineで検索するとどうしても時間がかかるので、
> BLAST検索を自分のPCで行いたいと思っています。
> 検索内容は遺伝子の相同性検索です。
自分のPCでは動かしたことありませんが・・・
「遺伝子の相同性検索」っていうんですから、Genbankのデータ
全部落とすんですか? 極一部だけでなく?
Genbankのデータって、全部で70G?以上あったと思いますけど。
そして日に日に増えています。
「On lineで検索するとどうしても時間がかかる」ということですが、
どこのサイトに何残基くらいの検索をかけているのですか?
「自分のPC」より、はるかに高性能のコンピュータで処理している
と思いますが。
私のいるところでは、解析ソフトとしてGCGを使っていますが、
データはもう維持すること自体が大変と言うことで、持つことは
やめました。もっぱらOn lineで検索しています。 |
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