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(無題) 削除/引用 No.8076-7 - 2019/07/16 (火) 14:22:45 - qPCR初心者 SYBR masterさん、ご回答ありがとうございます。 ご返信遅くなり、申し訳ありません。 プローブの基本的な設計条件、 設計支援用のサイトまで教えてくださり、ありがとうございます。 教えて頂いた条件も併せてプライマープローブを設計して、 まずは、予備実験に取り掛かかってみます。 ありがとうございました。

(無題) 削除/引用 No.8076-6 - 2019/07/13 (土) 09:34:28 - SYBR master 基本的には、 1.　probeが付くstrandに対するprimerより、Tmは少なくとも5度,可能なら8度以上、高く設定　primerより早くstrandにアクセスさせるため primerのTmが58-60度、probeのTmは68-70度が理想 2. 可能な限りPCR productsの中央に設定 3. exon-exon junction上に設定 4. 長さに制限があったかどうか覚えてません。 primer3でも設定できますが、 理研が開発した設計支援用のサイトもあります。 edesign primerで検索してみてください。 reference PLOS ONE, doi: 10.1371/journal.pone.0146950 どちらが優れているかは、基本TaqManは行わないので、これまで使ったことありませんので、よく解らないです。

(無題) 削除/引用 No.8076-5 - 2019/07/13 (土) 08:30:39 - qPCR初心者 おおさん、ご返信ありがとうございます。 論文のURLもありがとうございます。 読んでみようと思ったのですが、オープンアクセスではないので現在は読めませんでした。 書き忘れていましたが、設計しようとしているプローブは、TaqManプローブです。 SYBR Greenのプローブは使用しません。

(無題) 削除/引用 No.8076-4 - 2019/07/13 (土) 08:26:19 - qPCR初心者 ふらいむさん、ご返信ありがとうございます。 これはプライマーの条件だと思われるのですが、プローブもプライマーと同じような条件を考慮したらよろしいのでしょうか。

(無題) 削除/引用 No.8076-3 - 2019/07/13 (土) 05:27:15 - おお https://link.springer.com/protocol/10.1007%2F978-1-4939-2365-6_3 qPCRのプローブって色んな種類がなかったっけ、、、

(無題) 削除/引用 No.8076-2 - 2019/07/12 (金) 22:24:20 - ふらいむ ここらへんを読んでおけば概ねポイントは押さえられるかと。 http://catalog.takara-bio.co.jp/product/basic_info.php?unitid=U100004242

リアルタイムPCR　プローブ設計 削除/引用 No.8076-1 - 2019/07/12 (金) 15:46:07 - qPCR初心者 リアルタイムPCRのプローブを設計したいのですが、 ネット上で設計条件を探してもなかなか出てきません。 プライマーの設計条件の情報は多いのですが、 一般的にプローブを設計する際の条件はなにがあるのでしょうか。 初歩的質問で申し訳ないのですが、ご教授頂けませんでしょうか。

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