Bio Technical フォーラム

  • バイオ関連の実験をする上での、試薬、機器、プロトコールなどの情報交換の場です。
  • 新しいテーマで話を始める場合、質問をする場合は「新しいトピックを作る」から書き込みをしてください。
  • 質問に対して解答できる方は是非、書き込んで下さい。
  • このフォーラムにふさわしくないと管理人が判断した投稿は予告なく削除します。

新しいトピックを作る | トピック一覧 | 研究留学ネットに戻る

ひとつ前のフォーラム(readのみ)

このスレッドをはてなブックマークに追加このスレッドをはてなブックマークに追加

splicingについて トピック削除
No.8831-TOPIC - 2020/05/08 (金) 12:31:07 - うさぎ
いつも質問させていただいております。

splicingについての質問です。
転写後に間のintronやexonを除去して様々なtranscriptを作りますが
間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。

詳しい方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。
 
- このトピックにメッセージを投稿する -



3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


(無題) 解決済み 削除/引用
No.8831-3 - 2020/05/09 (土) 20:02:35 - うさぎ
ありがとうございます。
転写開始点が異なっているかを調べるために5´RACEをしてみることになりました。

(無題) 削除/引用
No.8831-2 - 2020/05/08 (金) 12:51:23 - おお

> 間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。
>

5’末端の配列が違うのはおそらく転写開始位置が違うのだろうと思います。またあるmRNAにおいて複数の転写開始点がある場合、上流の転写開始位置から転写が始まり、下流の転写開始位置のあたりをスプライシングで飛ばして、Exon2につながっていたりすることもあるでしょう。

参考にした配列が完全長ではなくって5’末端の配列がないこともありえます。

splicingについて 削除/引用
No.8831-1 - 2020/05/08 (金) 12:31:07 - うさぎ
いつも質問させていただいております。

splicingについての質問です。
転写後に間のintronやexonを除去して様々なtranscriptを作りますが
間ではなく端っこの5'末端(5'UTRやexon1)がsplicingで切り落とされる可能性はありえますでしょうか。

詳しい方がいらっしゃいましたらお教えいただけますと幸いです。
よろしくお願い致します。

3件 ( 1 〜 3 )  前 | 次  1/ 1. /1


パスワードを入力してチェックした記事を チェックした記事を

このトピックにメッセージを投稿する
名前 
メール   アドレス非公開
   タイトル 
本文      
設定  クッキーを保存(次回の入力の手間を省けます)
上に上げない(トピックの一覧で一番上に移動させません)
解決(問題が解決した際にチェックしてください)
暗証  半角英数字8-12文字の暗証番号を入れると、あとで削除、修正ができます。
送信 

〔使い方〕
  • 「アドレス非公開」をチェックすれば、自分のメールアドレスを公開しないで他の方からメールを受け取れます。
  • 問題が解決した際には、解決ボタンをチェックして解決した旨のコメントをつけてください。これは、初めにトピックを作った人と管理人のみが可能です。
  • 半角カタカナ、機種依存文字(全角ローマ数字、○の中の数字等)は文字化けの原因となりますので使わないでください。