Bio Technical フォーラム

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(無題) 削除/引用
No.932-3 - 2012/09/15 (土) 14:07:50 - おお
けいだいをかさねた細胞は効率が悪くなってくるのはありますが、それはかい方にもよるかもしれませんが2ー3ヶ月という人もいます。TFの効率とどのような関係があるのかはおいておいて、けいだいを重ねていくと、そのうち増殖速度がかわってきて(はやくなるのがたいてい)、細胞が小さくなってきたりとか形態の変化もともないます。たいていの場合はそういうのとTF効率の悪化は並行して起こるような印象です。細胞を使う時にある程度増殖させてなるべく多くの細胞を凍結して置く方がいいかと思います。けいだいのかいすうからして、そんなに問題がおこりそうな回数でもないとはおもいますよ。ただしけいだいのしかたがらんぼうだとすぐへんになるかもしれません。とくにTFようにまいたさいぼうのじょうたいがまいかいちがうとかだとまいかいかなりばらつきがでるかもしれません。

あまり起こってほしくないものとして、マイコプラズマ感染などもあります。そういう細胞は直ぐに変になるか、気がつかないで買っていて突然変になることがおおいです。

あとは血清のロットの影響も無視できないことがあるかもしれません。

変になるとなかなかとらえどころがないので、最初にどれだけ準備が整えられるかというのもあるかもしれませんね。たとえば、ほかの細胞でTFしたことがあるなら、その細胞でも効率が変わっているか確かめることで何処が問題か炙り出し易いかもしれません。

DNAは電気えいどうでだいじょうぶなら、DNA自身はもんだいないとおもいます。

TFのあとのさいぼうの調子はどうですか?

(無題) 削除/引用
No.932-2 - 2012/09/15 (土) 13:39:22 - 直輝
DNAは原因でないと思います。
数十回凍結融解しても問題ないはず。

継代回数も可能性としては低いと思います。
私は半年以上継代した293細胞を使ってトランスフェクションしたりしますが、特別に問題になったことはありません。

トランスフェクション効率に一番影響が大きいのは、トランスフェクション時の細胞密度だと思います。
細胞数は毎回一定に播種できていますか?
10〜20%程度の細胞密度の違いでも、発現量が2倍くらい変わったりしますよ。

トランスフェクション効率の再現性 削除/引用
No.932-1 - 2012/09/15 (土) 10:51:25 - Atail
PEIを用いて293Tのトランスフェクション(TF)を行っています。当方細胞培養は今年始めたばかりなのですが、発現レベルの再現性が取れず困っております(去年まで微生物屋でした)。

PEIはずっと同じものを使用しています。細胞の状態及びTFの方法を改めて見直したが、特に問題は見当たらず、いまはTFに用いたプラスミドDNAの品質を疑っております。

このプラスミドDNAですが、8/24に invitrogen midi-prep で精製しており、8/24及び8/27に行ったTFでは充分な発現レベルが認められました。ところがその後、9/5、9/10に行ったTFでは、WBで弱々しいバンドしか検出できない程度にしか発現しておりませんでした。電気泳動で確認する限りnickが増えたというようなことは見られないですし、精製してから3週間のうちに凍結融解は上記の通り4、5回程度しか行っていません。

このような状況にありますが、DNAが原因ということは有り得ますでしょうか?或いは、3週間のうちに293Tは6回ほど継代していますが、継代回数はTF効率に影響するでしょうか。ちなみに、凍結ストックからおこして現時点で9回目の継代です。他にも考えられる原因がありましたら是非ご指摘頂ければと思います。

なおWBですが、「発現していたときのlysate」を常に等量流して比較しております。内部標準のWBは行っていませんが、流した総タンパク質量はほぼ同じであることはponseauで確認できております(そもそもbradfordで計測した濃度に基づき等量流していますが、実験ごとに大きなばらつきが生じていないことを確認しているという意味です)。

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