Bio Technical フォーラム

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No.9334-5 - 2020/11/25 (水) 04:10:30 - ICC
おおさん、はい、そうなのですが、わざわざそんなに低いものを調製する目的はなんだろうと思ったので書きました。ひょっとして前任の方ももしかしたら分子生物学に不慣れなため、そのような濃度になったのだとすれば、根本的なところから疑う材料の一つとしてプラスミドの濃度の低さがあるのかなと思いました。

トピックからずれてしまいました。すみません。

(無題) 削除/引用
No.9334-4 - 2020/11/25 (水) 03:24:06 - おお
>[Re:2] ICCさんは書きました :

>
> 最初のプラスミドの濃度も低いですね。

低い高いは置いといて、十分量のプラスミドで形質転換していると思いますが、、、

(無題) 削除/引用
No.9334-3 - 2020/11/25 (水) 03:21:37 - おお
普通はそんなに難航しないです。
10ulのコンピですが、購入したばあい100ulぐらいに分注されてますよね。すでに数回溶かしたり凍結したりしてないかなと思ったりします。プラスミドの分解が進んでいる可能性はないですか?一度電気泳動で確認するといいかと思います。

そもそも蛋白発現用のプラスミドではないですが、どのような理屈で蛋白を発現させようとしているか説明できますか?
プロモーターはLacZ用とT7があるようですが。場合によってはサブクローニングでよく使われるK株の大腸菌でもできるかもしれません。そちらのほうが形質転換効率は高いので。

何らかのポジコンがあれば問題解決がしやすいです。よく考えてみてください。

(無題) 削除/引用
No.9334-2 - 2020/11/25 (水) 03:10:34 - ICC
LBの消費期限は有効ですか?
回復培養液には抗生剤は入っていませんか?
BL21 de3は使ったことがありませんが、DH5αという大腸菌をよく使っており、氷上20分、42℃で35秒、氷上で3分ののち、1ml SOCを加え、1時間回復培養@37˚Cで行なっています。

最初のプラスミドの濃度も低いですね。
何か他のプラスミドをポジコン代わりに使えるといいですね。

【初心者】トラフォメができないってやばいですか? 削除/引用
No.9334-1 - 2020/11/25 (水) 00:39:04 - 限界集落
はじめまして。有機合成を行っていましたが、目的化合物を合成したのでアッセイ用に酵素を発現精製することになりました。

BL21 de3にトラフォメするにあたり、実験の勝手が違うためかなり気を付けて実験操作をしました。10 uLのコンピにプラスミド0.5 uLを加えて氷上5分, 45Cで40秒, 氷上2分, 40 uLのLBで回復培養30分, 計50 uLの溶液を抗生物質入りの寒天培地に塗布しましたが、24時間経過してもコロニーができません。

抗生物質はテトラサイクリン12 ug/mL、ベクターはpAlterに377残基のたんぱくなどを挿入しています。コンピは買ったやつをそのまま使いました。当研究室はプラスミドを設計できないので、5年前の先輩が大量に作ったプラスミド(-30C保存, 109 ng/uL)を用いました。

その昔はできていたそうですが、コツなどが先生の異動があって全く伝わってきていません。ラボでトラフォメのプロトコルがないのですが、教科書, CSH, 似たようなラボでのプロトコルと見比べてもどこが問題点かわからず、行き詰っています。現在は別の先輩が同じようにやってもうまく生えないこともあり、そもそもの実験系に疑問を抱いたため本フォーラムに投稿することにしました。

初心者ですが、通常のトラフォメはこんなに難航するんでしょうか。先輩は20時間で生えたと言っていましたが、抗生物質の半減期などを考えればそれを選択するのはどうなんだろうとも思っています。B4ですが卒論までに結果出せるか不安です。

また、生物実験のプロトコルは日々進化していると聞き、異なるやり方などあればご教授ください。EPは機材の関係で無理です。

何卒よろしくお願いいたします。

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