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抽出ゲノムDNAサイズ トピック削除
No.3962-TOPIC - 2011/02/09 (水) 22:52:56 - 超初心者
先日学生実験で、微生物からのゲノムDNA抽出実験をやりました。まったくの素人で申し訳ありません。大腸菌のゲノムは約4Mbpと聞きましたが、その抽出キットを使って取り出したDNAは、電気泳動によって、20kb程度のDNA断片が得られ、「あ〜成功しましたね〜」って先生に言われました。なんで、20kbpで成功なのかよく分かりません。どなたか教えて頂けませんか。
 
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どうもすみませんでした・・・^−^; 削除/引用
No.3962-7 - 2011/02/12 (土) 17:59:45 - 超初心者
みなさん、ご回答ありがとうございました。
知識がないまま、ここで質問をしてしまったことを反省しました。
図書館で少し調べてみたのですが、まだ、結論には至っておりません。
おはずかしいです。
そして、私のようなものに、レスして頂いた皆さん、どうもありがとうございました。
何とか自力でがんばってみたいと思います。

学生実験 削除/引用
No.3962-6 - 2011/02/12 (土) 16:54:50 - ?
学生実験なのであれば、ここで質問する以前に実習担当の先生に聞く方がいいと思うのですが・・・

質問するまでに自分なりに勉強して、考えられる(思いついた)可能性を先生に投げかけた上で、答えを求めては?

(無題) 削除/引用
No.3962-5 - 2011/02/12 (土) 14:15:42 - ~
頭をひねる前に 前提となる知識がないと、出てくるものも出てこないと思いますが。

何故20kb程度と思ったのですか?
20kb”程度”の"程度"の範囲はどのくらいですか?
その範囲の根拠は何ですか?
図書館にある該当する分野の本は一通り読み終わりましたか?
今後も実習・卒研等で判らないことがあったら、ネットで聞くつもりですか?

>微生物からのゲノムDNA抽出実験
>大腸菌のゲノムは約4Mbpと聞きました
抽出した実験対象が大腸菌とは書かれていませんが、なぜ大腸菌のゲノムサイズと得られたゲノムサイズを比較しているのですか?

>20kb程度でDNAをぷちんぷちんと切っていく何かがキットの中に入っているとか。。。それはないか^^;
キットの組成を見た上での判断ですか?
そのキットはどういう原理でDNAを抽出する事が出来るのですか?

まぁ 削除/引用
No.3962-4 - 2011/02/09 (水) 23:53:27 - ami
学生で十分たどり着ける結論だと思うので待つ。

(無題) 削除/引用
No.3962-3 - 2011/02/09 (水) 23:32:42 - 超初心者
amiさん、早速のレスありがとうございます。
考えられる可能性ですか。。。。
20kb程度でDNAをぷちんぷちんと切っていく何かがキットの中に入っているとか。。。それはないか^^;
う〜ん、制限酵素とかっていうのは、ある特定の配列で切るんですよねえ。でも、抽出をしているのであって、切っているわけじゃないし。。。PCRっていうのは、目的の断片だけを増幅していく手法だし。。。
う〜ん、ないあたまをひねるのも楽じゃないですね。

まずは 削除/引用
No.3962-2 - 2011/02/09 (水) 23:18:00 - ami
考えられる可能性を挙げてみるのが大事であります。

抽出ゲノムDNAサイズ 削除/引用
No.3962-1 - 2011/02/09 (水) 22:52:56 - 超初心者
先日学生実験で、微生物からのゲノムDNA抽出実験をやりました。まったくの素人で申し訳ありません。大腸菌のゲノムは約4Mbpと聞きましたが、その抽出キットを使って取り出したDNAは、電気泳動によって、20kb程度のDNA断片が得られ、「あ〜成功しましたね〜」って先生に言われました。なんで、20kbpで成功なのかよく分かりません。どなたか教えて頂けませんか。

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