はじめまして。
約200万ファイルのワンパスシーケンスの結果(1シーケンス/ファイル)をアッセンブルし、遺伝子領域を予測したいと思っております。
@アッセンブルについて
当初Atlasを使おうと思っておりましたが、どうやらPhrapを要求するようで、コマーシャルユーザーである私には使うことが出来なさそうです。またTigrのAMOSも見つけたのですが、開発途中のようなのです(一応完成はしているようなのですが)。
どなたか信頼性が高くて、実績もあり、そこそこ早いソフトをご存知ありませんでしょうか。
A遺伝子領域の予測について
いろいろなソフトがありますが、実績という面で調べきることが出来ません。良く使われているという面で、ご存知のソフトをご紹介頂けませんでしょうか。出来れば、アウトプットとして、予測した遺伝子領域の配列のみをMultiFastaで出力出来るようだと非常に助かります。 |
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